RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534160.1

GMDS-AS1-212, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 720 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.31□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR5AC2Q9NZP5 309 aa3.31□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GSKIPQ9P0R6 139 aa3.31□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 H3BVH4 76 aa3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAUP35544 74 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF56Q15929 161 aa3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM97Q5BJF2 176 aa3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CARD19Q96LW7 228 aa3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DERL1Q9BUN8 251 aa3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MIXL1Q9H2W2 232 aa3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OTORQ9NRC9 128 aa3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.29□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 M0R381 172 aa3.29□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GNG5P63218 68 aa3.29□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HBG1P69891 147 aa3.29□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HBG2P69892 147 aa3.29□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TPRXLQ17RH7 258 aa3.29□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MITD1Q8WV92 249 aa3.29□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 Q9H521 79 aa3.29□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 VCX3AQ9NNX9 186 aa3.29□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IL36BQ9NZH7 164 aa3.29□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.28□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.28□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 B4DEV8 164 aa3.28□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HRES1P13985 223 aa3.28□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 S100A11P31949 105 aa3.28□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KHDC3LQ587J8 217 aa3.28□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 STX12Q86Y82 276 aa3.28□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SFRP2Q96HF1 295 aa3.28□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.28□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C9orf170A2RU37 121 aa3.27□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ARMS2P0C7Q2 107 aa3.27□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PMCHP20382 165 aa3.27□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SULT1A1P50225 295 aa3.27□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TAS2R45P59539 299 aa3.27□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AP3S2P59780 193 aa3.27□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RAB4BP61018 213 aa3.27□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRNTQ86SH4 94 aa3.27□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AQP10Q96PS8 301 aa3.27□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IGSF23A1L1A6 192 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GRIFINA4D1Z8 144 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 M0R036 132 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 UBE2L6O14933 153 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 STAG3L3P0CL85 134 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPCS2Q15005 226 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ATP6V1FQ16864 119 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IQCJQ1A5X6 159 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM162BQ5T6X4 162 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZFP82Q8N141 532 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LINC00526Q96FQ7 95 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 USH2AO75445 5202 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CENPXA8MT69 81 aa3.25□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM25EA8MYX2 175 aa3.25□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C17orf112F2Z3M2 114 aa3.25□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BCL2P10415 239 aa3.25□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FGF6P10767 208 aa3.25□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PSMB2P49721 201 aa3.25□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TSKUQ8WUA8 353 aa3.25□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.25□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 R4GN34 69 aa3.25□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FABP5P3A8MUU1 101 aa3.24□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TCRAP04437 139 aa3.24□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMBIM6P55061 237 aa3.24□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.24□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C5orf17Q8NAS9 161 aa3.24□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ORAOV1Q8WV07 137 aa3.24□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A0A087WXM4 84 aa3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 XCL1P47992 114 aa3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 UBE2BP63146 152 aa3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FA2HQ7L5A8 372 aa3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A0A1W2PPV4 95 aa3.22□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 APOMO95445 188 aa3.22□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SMIM17P0DL12 118 aa3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.4 ms