RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ENHOQ6UWT2 76 aa4.54□□□□□ -1.68
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FDCSPQ8NFU4 85 aa4.54□□□□□ -1.68
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.54□□□□□ -1.68
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa4.53□□□□□ -1.68
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A0J9YX75 114 aa4.53□□□□□ -1.68
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LCE6AA0A183 80 aa4.53□□□□□ -1.68
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LOC730098B7Z3J9 87 aa4.53□□□□□ -1.68
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.53□□□□□ -1.68
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q8N377 158 aa4.52□□□□□ -1.69
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.52□□□□□ -1.69
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRR34Q9NV39 138 aa4.52□□□□□ -1.69
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa4.52□□□□□ -1.69
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 NDUFAF8A1L188 74 aa4.5□□□□□ -1.69
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGLV7-43P04211 117 aa4.5□□□□□ -1.69
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGKV2-30P06310 120 aa4.5□□□□□ -1.69
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.5□□□□□ -1.69
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 I3L3M4 83 aa4.49□□□□□ -1.69
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGKV1-17P01599 117 aa4.49□□□□□ -1.69
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ERHP84090 104 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.48□□□□□ -1.69
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.48□□□□□ -1.69
SOX9-AS1-211ENST00000533179 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.48□□□□□ -1.69
SOX9-AS1-211ENST00000533179 M0R1W7 72 aa4.48□□□□□ -1.69
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LINC00208Q96KT6 92 aa4.48□□□□□ -1.69
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TTTY12Q9BZ98 90 aa4.48□□□□□ -1.69
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 LCE4AQ5TA78 99 aa4.46□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COX14Q96I36 57 aa4.46□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RNF5Q99942 180 aa4.46□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa4.45□□□□□ -1.7
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.45□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.45□□□□□ -1.7
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa4.44□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa4.44□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1W2PPR1 153 aa4.44□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 STATHP02808 62 aa4.44□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCL18P55774 89 aa4.44□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa4.44□□□□□ -1.7
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 PCNTO95613 3336 aa4.43□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa4.43□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H0Y9P7 68 aa4.43□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLK12Q9UKR0 248 aa4.43□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NDUFA3O95167 84 aa4.42□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCL3L1P16619 93 aa4.42□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CR1P17927 2039 aa4.42□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PDE6GP18545 87 aa4.42□□□□□ -1.7
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q5W150 140 aa4.42□□□□□ -1.7
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.41□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UQCR11O14957 56 aa4.41□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CTSGP08311 255 aa4.41□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MGPP08493 103 aa4.41□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DEFB119Q8N690 84 aa4.41□□□□□ -1.7
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PDE6HQ13956 83 aa4.4□□□□□ -1.71
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.4□□□□□ -1.71
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.4□□□□□ -1.71
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.4□□□□□ -1.71
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MED12Q93074 2177 aa4.4□□□□□ -1.71
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa4.39□□□□□ -1.71
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF137PP52743 207 aa4.39□□□□□ -1.71
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.39□□□□□ -1.71
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