RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 NRACQ8N912 160 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 A8MWL6 223 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 SMKR1H3BMG3 65 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 TEX46H3BTG2 121 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 AMN1Q8IY45 258 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 NUPR1O60356 82 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 A0A1B0GUT8 65 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 KIR2DL4Q99706 377 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRU-209ENST00000526080 CRYGAP11844 174 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 CDIP1Q9H305 208 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 HIGD1CA8MV81 97 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 PPP1R17O96001 155 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM18Q96B42 140 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 BORCS7Q96B45 105 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 PPP1R2P9O14990 202 aa8□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 C2orf82Q6UX34 121 aa8□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 C22orf24Q9Y442 160 aa8□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 IFITM10A6NMD0 228 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 HBBP68871 147 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM250H0YL14 139 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 BCE1O60756 84 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 C20orf78Q9BR46 151 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRU-209ENST00000526080 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 TCAPO15273 167 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF727A8MUV8 499 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 RGS21Q2M5E4 152 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 LINC01551Q86U37 167 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 CTAG1AP78358 180 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 RIGQ13278 110 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 OSTCQ9NRP0 149 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00862A6NCI5 91 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 V9GYV3 84 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 TNFRSF6BO95407 300 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRU-209ENST00000526080 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 CKS2P33552 79 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 SLC51BQ86UW2 128 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 Q8IZM0 81 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00167Q96N53 147 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 D6R8Y8 96 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 NPYP01303 97 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 CEBPGP53567 150 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 CKS1BP61024 79 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 Q6ZN92 141 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM141Q96I45 108 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 PRSS2P07478 247 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 A0A1B0GW15 77 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 F8VRH5 84 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRU-209ENST00000526080 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.84□□□□□ -1.15
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