RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524536.5

USP33-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 33, humanhuman

TSL 3

Gene USP33, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33-211ENST00000524536 PAGE4O60829 102 aa7.14□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 IFNA1P01562 189 aa7.14□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 C22orf24Q9Y442 160 aa7.14□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.13□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.13□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.13□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 PFDN1O60925 122 aa7.13□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 ENKURQ8TC29 256 aa7.13□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.12□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.12□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 CNFNQ9BYD5 112 aa7.11□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 ST20Q9HBF5 79 aa7.11□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.11□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 M0R2T5 61 aa7.1□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 DEFA1P59665 94 aa7.1□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.1□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.09□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.09□□□□□ -1.27
USP33-211ENST00000524536 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.08□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.07□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 RAB19A4D1S5 217 aa7.07□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 TNFRSF6BO95407 300 aa7.07□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 UBE2AP49459 152 aa7.07□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 SMIM12Q96EX1 92 aa7.07□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 BIN3Q9NQY0 253 aa7.07□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 UPK1BO75841 260 aa7.06□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 FCER1GP30273 86 aa7.06□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 DAND5Q8N907 189 aa7.06□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 TMEM18Q96B42 140 aa7.06□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 ZNF727A8MUV8 499 aa7.05□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 KIAA0087Q14695 138 aa7.05□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.05□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 VCYO14598 125 aa7.04□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 CENPWQ5EE01 88 aa7.04□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.04□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 KIR2DL4Q99706 377 aa7.04□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.04□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.04□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.03□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 Q6ZUT4 128 aa7.03□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.03□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.03□□□□□ -1.28
USP33-211ENST00000524536 GNG4P50150 75 aa7.02□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.02□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.01□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.01□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 CCL20P78556 96 aa7.01□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 C2orf82Q6UX34 121 aa7.01□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.01□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.01□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 NUDT11Q96G61 164 aa7.01□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 LINC00167Q96N53 147 aa7.01□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.01□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 LCE5AQ5TCM9 118 aa7□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 C3orf22Q8N5N4 141 aa7□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 C11orf52Q96A22 123 aa7□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 A0A1B0GV50 99 aa6.99□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 SPINK1P00995 79 aa6.99□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.99□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 PPP1R17O96001 155 aa6.98□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.97□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 CKS1BP61024 79 aa6.97□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 HBBP68871 147 aa6.97□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.97□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.97□□□□□ -1.29
USP33-211ENST00000524536 IFITM10A6NMD0 228 aa6.96□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 UMAD1C9J7I0 102 aa6.96□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 PRSS2P07478 247 aa6.96□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 MANBALQ9NQG1 85 aa6.96□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 SSPOA2VEC9 5147 aa6.95□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.95□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.95□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 S100ZQ8WXG8 99 aa6.95□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.95□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.95□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.95□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 GAGE10A6NGK3 116 aa6.94□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 TCAPO15273 167 aa6.94□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 RAB4AP20338 218 aa6.94□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.94□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 BORCS7Q96B45 105 aa6.94□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.94□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.93□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 PPP1R2P9O14990 202 aa6.93□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 Q5BKY6 102 aa6.93□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.92□□□□□ -1.3
USP33-211ENST00000524536 PDE6DO43924 150 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.9 ms