RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523364.1

HOXA-AS2-209, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXA-AS2, Length 989 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TMEM18Q96B42 140 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LINC00862A6NCI5 91 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SPAG11BQ08648 103 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 DIRC1Q969H9 104 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IMMP2LQ96T52 175 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C20orf78Q9BR46 151 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGLV7-43P04211 117 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C1orf137Q5JT78 98 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 V9GYV3 84 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MUC17Q685J3 4493 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 A0A1B0GW15 77 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZNF727A8MUV8 499 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 Q6ZUT4 128 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C5orf38Q86SI9 138 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 H0Y9J4 135 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SMKR1H3BMG3 65 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NDUFA1O15239 70 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CEBPGP53567 150 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 FAM104AQ969W3 186 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 A0A087WZ39 114 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 HBBP68871 147 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TNFRSF6BO95407 300 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PPBPP02775 128 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 S100A8P05109 93 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CKS2P33552 79 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IFITM10A6NMD0 228 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 F8W036 122 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KIAA0087Q14695 138 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C10orf25Q5T742 122 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 AKAP14Q86UN6 197 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NAT8Q9UHE5 227 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 FAM168BA1KXE4 195 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LCE3BQ5TA77 95 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 A0A1B0GXF2 115 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PRSS47A8MTI9 375 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 D6R8Y8 96 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 M0QXV9 152 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NPYP01303 97 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ADIRFQ15847 76 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NPSP0C0P6 89 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RAB5AP20339 215 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 UBE2D1P51668 147 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 UBE2BP63146 152 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GAGE2EQ4V326 116 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ORMDL3Q8N138 153 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NUPR1O60356 82 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZNF861PO60384 105 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms