RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 HILS1P60008 231 aa5.75□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 MUC4Q99102 2169 aa5.75□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 PLNP26678 52 aa5.75□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.75□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 Q8N2B8 174 aa5.74□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.74□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 MED14OSP0DP75 135 aa5.74□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 NRACQ8N912 160 aa5.74□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 CFC1BP0CG36 223 aa5.74□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 CFC1P0CG37 223 aa5.74□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.73□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.73□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.73□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.73□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB130BP0DP73 79 aa5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB130AP0DP74 79 aa5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 PROK1P58294 105 aa5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0B4J2C4 111 aa5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM243Q9BU79 118 aa5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.71□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 F8VRH5 84 aa5.71□□□□□ -1.49
TRPS1-208ENST00000519076 I3L3M4 83 aa5.71□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.71□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.71□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 HIVEP1P15822 2718 aa5.71□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF815PA8K554 130 aa5.71□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZRU5 148 aa5.71□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF575Q86XF7 245 aa5.71□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 LINC01546A6NGU7 62 aa5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 H7C423 109 aa5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3-33P01772 117 aa5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 PRR15Q8IV56 129 aa5.69□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.69□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 M0QY20 66 aa5.69□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2L6O14933 153 aa5.69□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 FHL2Q14192 279 aa5.69□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 ZFHX3Q15911 3703 aa5.69□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 TOMM6Q96B49 74 aa5.69□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 HTN3P15516 51 aa5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZTI0 123 aa5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 Q9UF83 564 aa5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 RHOHQ15669 191 aa5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 Q1RN00 199 aa5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 STAB1Q9NY15 2570 aa5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 PRSS2P07478 247 aa5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3-30P01768 117 aa5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 COX6CP09669 75 aa5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 COL6A5A8TX70 2615 aa5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 PAX4O43316 350 aa5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.66□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.66□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0J9YY99 117 aa5.66□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB4AO15263 64 aa5.66□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV1-51P01701 117 aa5.66□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM141Q96I45 108 aa5.66□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 NOTCH1P46531 2555 aa5.66□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 H7C2G1 150 aa5.66□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00315P59091 139 aa5.66□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0J9YXV3 536 aa5.65□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.65□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 C11orf86A6NJI1 115 aa5.65□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L23D6RBM5 183 aa5.65□□□□□ -1.5
TRPS1-208ENST00000519076 NXPH4O95158 308 aa5.65□□□□□ -1.5
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