RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504624.1

PDE4D-211, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-211ENST00000504624 ERC2-IT1O76042 136 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGHV1-46P01743 117 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGHV3-30P01768 117 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGHV3-33P01772 117 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 CRPP02741 224 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 CLPSP04118 112 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF137PP52743 207 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 MIAQ16674 131 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 C4orf26Q17RF5 130 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 FAM27BQ5VT28 67 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 SFTA2Q6UW10 78 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF826PQ6ZT77 177 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 LINC00305Q7Z4B0 112 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 ADM2Q7Z4H4 148 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 FAM216BQ8N7L0 139 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TOMM6Q96B49 74 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 FXYD5Q96DB9 178 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM141Q96I45 108 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 FAM19A4Q96LR4 140 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 SCGB3A1Q96QR1 104 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TIMM21Q9BVV7 248 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 CRCT1Q9UGL9 99 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 HHLA3Q9XRX5 114 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 LAMA1P25391 3075 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 XIRP2A4UGR9 3374 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 ABCA1O95477 2261 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 C5orf42Q9H799 3197 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TRIOO75962 3097 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 MED13LQ71F56 2210 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TRAV7A0A075B6U4 112 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 A0A1W2PNN7 141 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 C17orf98A8MV24 154 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 H3BQ85 93 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 H7BZZ5 65 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 LEPROTO15243 131 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 NDUFS5O43920 106 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 LYZL6O75951 148 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 FSTL3O95633 263 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 STATHP02808 62 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 CD52P31358 61 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 DAD1P61803 113 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 ERHP84090 104 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 PMAIP1Q13794 54 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 ESRGQ1W209 222 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 DYNAPQ8N1N2 210 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 UBE2E2Q96LR5 201 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TTTY13Q9BZ97 58 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 UBL5Q9BZL1 73 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 DPH3P1Q9H4G8 78 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 LENEPQ9Y5L5 61 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 CR1P17927 2039 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 BRCA2P51587 3418 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 CEP250Q9BV73 2442 aa1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 COL6A6A6NMZ7 2263 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 ABCA2Q9BZC7 2435 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 DSPP15924 2871 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 CHD9Q3L8U1 2897 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 CELSR2Q9HCU4 2923 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 NCOR2Q9Y618 2525 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 E7EQL1 145 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 UBE2L6O14933 153 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 NDUFA3O95167 84 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 HRES1P13985 223 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 RBM3P98179 157 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 DEFB110Q30KQ9 67 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 SPINK9Q5DT21 86 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 HCP5Q6MZN7 132 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 LYZL1Q6UWQ5 148 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 PRNTQ86SH4 94 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 C20orf197Q8N268 126 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 LINC00311Q8N616 119 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 C3orf56Q8N813 242 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 WFDC11Q8NEX6 87 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 SMCR5Q8TEV8 140 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 DCANP1Q8TF63 244 aa1.05□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
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