RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 C15orf56Q8N910 161 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM104AQ969W3 186 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 PKD1P98161 4303 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 HSBP1O75506 76 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 PMVKQ15126 192 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A087WZ39 114 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 C5orf38Q86SI9 138 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 C2orf48Q96LS8 159 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP10-1P60331 282 aa9.46□□□□□ -0.9
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SH3BP2-208ENST00000504294 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.45□□□□□ -0.9
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SH3BP2-208ENST00000504294 CST9LQ9H4G1 147 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP2-208ENST00000504294 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
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SH3BP2-208ENST00000504294 H3BRM9 83 aa9.43□□□□□ -0.9
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SH3BP2-208ENST00000504294 HIST1H2BJP06899 126 aa9.35□□□□□ -0.91
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SH3BP2-208ENST00000504294 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.35□□□□□ -0.91
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SH3BP2-208ENST00000504294 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-208ENST00000504294 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-208ENST00000504294 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-208ENST00000504294 SCXQ7RTU7 201 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-208ENST00000504294 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-208ENST00000504294 COX7B2Q8TF08 81 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-208ENST00000504294 EPM2AB3EWF7 344 aa9.31□□□□□ -0.92
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