RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 LINC00474Q9P2X8 69 aa14.16□□□□□ -0.14
SENP6-211ENST00000493959 IFITM10A6NMD0 228 aa14.15□□□□□ -0.14
SENP6-211ENST00000493959 PRSS47A8MTI9 375 aa14.15□□□□□ -0.14
SENP6-211ENST00000493959 MT1HL1P0DM35 61 aa14.15□□□□□ -0.14
SENP6-211ENST00000493959 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.14□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 A0A1W2PNN7 141 aa14.14□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 APOMO95445 188 aa14.14□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 IFITM2Q01629 132 aa14.14□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 SPAG11BQ08648 103 aa14.14□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 C2orf48Q96LS8 159 aa14.14□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 PRR3P79522 188 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 TNXBP22105 4242 aa14.12□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.12□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 ADCYAP1P18509 176 aa14.12□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.12□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.12□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.12□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 Q8N8P6 123 aa14.11□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 PKIGQ9Y2B9 76 aa14.11□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa14.11□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 C10orf25Q5T742 122 aa14.1□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa14.1□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.1□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 LINC00242Q5T6M2 205 aa14.09□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 OR10D4PQ8NGN7 298 aa14.09□□□□□ -0.15
SENP6-211ENST00000493959 TMEM218A2RU14 115 aa14.08□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa14.08□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 TMEM141Q96I45 108 aa14.07□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.07□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 RNF151Q2KHN1 245 aa14.06□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 KIAA1644Q3SXP7 199 aa14.06□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 C2orf66Q6UXQ4 117 aa14.06□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 KIAA0087Q14695 138 aa14.05□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 A0A087WZ39 114 aa14.04□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 UBE2D1P51668 147 aa14.04□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 LINC00173Q6ZV60 143 aa14.04□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 IMMP2LQ96T52 175 aa14.04□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 CYSLTR1Q9Y271 337 aa14.04□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.03□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 NDUFA1O15239 70 aa14.03□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 UQCC3Q6UW78 93 aa14.03□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 TEX43Q6ZNM6 134 aa14.03□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 C6orf48Q9UBA6 75 aa14.03□□□□□ -0.16
SENP6-211ENST00000493959 IGIPA6NJ69 53 aa14.02□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.02□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.01□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 Q6ZRP5 223 aa14.01□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 AMELXQ99217 191 aa14.01□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 VCX2Q9H322 139 aa14.01□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 UBR4Q5T4S7 5183 aa14.01□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 FAM168BA1KXE4 195 aa13.99□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 F8WDY8 70 aa13.99□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 C2orf82Q6UX34 121 aa13.99□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa13.99□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 ODF1Q14990 250 aa13.98□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 C2orf88Q9BSF0 95 aa13.98□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 SPINK6Q6UWN8 80 aa13.97□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 Q6ZN92 141 aa13.97□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 LINC01600Q96MT4 127 aa13.97□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 SEC11CQ9BY50 192 aa13.97□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa13.97□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 K7EMI3 77 aa13.96□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.96□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 GAGE2EQ4V326 116 aa13.96□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 COMMD7Q86VX2 200 aa13.96□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13.96□□□□□ -0.17
SENP6-211ENST00000493959 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa13.94□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa13.94□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa13.94□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 LINC01561Q8N1V8 128 aa13.93□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 TOMM6Q96B49 74 aa13.93□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 MT-ND6P03923 174 aa13.91□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 NPSP0C0P6 89 aa13.91□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa13.91□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 GNB1LQ9BYB4 327 aa13.91□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 TOMM7Q9P0U1 55 aa13.91□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 S100PP25815 95 aa13.9□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP10-8P60410 259 aa13.9□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa13.9□□□□□ -0.18
SENP6-211ENST00000493959 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa13.89□□□□□ -0.19
SENP6-211ENST00000493959 C1orf137Q5JT78 98 aa13.89□□□□□ -0.19
SENP6-211ENST00000493959 C10orf91Q5T1B1 145 aa13.89□□□□□ -0.19
SENP6-211ENST00000493959 SCGB3A1Q96QR1 104 aa13.89□□□□□ -0.19
SENP6-211ENST00000493959 TIMM17AQ99595 171 aa13.89□□□□□ -0.19
SENP6-211ENST00000493959 REG3GQ6UW15 175 aa13.88□□□□□ -0.19
SENP6-211ENST00000493959 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
SENP6-211ENST00000493959 G0S2P27469 103 aa13.87□□□□□ -0.19
SENP6-211ENST00000493959 C6orf226Q5I0X4 101 aa13.87□□□□□ -0.19
SENP6-211ENST00000493959 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
SENP6-211ENST00000493959 ERASQ7Z444 233 aa13.87□□□□□ -0.19
SENP6-211ENST00000493959 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms