RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493831.1

ETV1-222, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 2

Gene ETV1, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-222	ENST00000493831	CD14	P08571	375 aa		0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	OR5G3	P0C626	314 aa		0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	OMP	P47874	163 aa		0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	CCL20	P78556	96 aa		0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	C4orf22	Q6V702	233 aa		0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	C22orf24	Q9Y442	160 aa		0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		0.4	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	DNAL4	O96015	105 aa		0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	DHFR	P00374	187 aa		0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	FXYD6P3	P58550	94 aa		0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	RHEB	Q15382	184 aa		0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831		Q56UQ5	140 aa		0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	TERB2	Q8NHR7	220 aa		0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	TOMM6	Q96B49	74 aa		0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831		V9GYS6	101 aa		0.39	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831		A0A087WX48	190 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	CCDC160	A6NGH7	325 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	CDC42EP2	O14613	210 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	CYB5B	O43169	146 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	HYPM	O75409	117 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	TCL1B	O95988	128 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	RBP1	P09455	135 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	SMIM17	P0DL12	118 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	CDKN2C	P42773	168 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	RAB4B	P61018	213 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	WT1-AS	Q06250	92 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831		Q6ZQT0	140 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	OSTC	Q9NRP0	149 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	RBAKDN	A6NC62	111 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831		A8MT66	165 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	OR4E1	P0C645	316 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	QRFP	P83859	136 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	SPA17	Q15506	151 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	LINC01554	Q52M75	96 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831		Q5XG85	94 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	BORCS5	Q969J3	196 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	TMEM203	Q969S6	136 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	BORCS7	Q96B45	105 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	PDE6D	O43924	150 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	ERC2-IT1	O76042	136 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	APOA2	P02652	100 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	APOC1	P02654	83 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	TTR	P02766	147 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	PIGY	Q3MUY2	71 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	TEX261	Q6UWH6	196 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	OR4K15	Q8NH41	348 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
ETV1-222	ENST00000493831	BTF3L4	Q96K17	158 aa		0.36	□□□□□ -2.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms