RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 A8MWL6 223 aa8.3□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.3□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 TMEM18Q96B42 140 aa8.3□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.29□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 RAB4AP20338 218 aa8.29□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 CT83Q5H943 113 aa8.29□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 OCC1Q8TAD7 63 aa8.29□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 BORCS7Q96B45 105 aa8.29□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 KIR2DL4Q99706 377 aa8.29□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.29□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 HMSDA8MTL9 139 aa8.28□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 PPP1R17O96001 155 aa8.28□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 CTAG1AP78358 180 aa8.28□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 KIAA0087Q14695 138 aa8.28□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.28□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM104AQ969W3 186 aa8.27□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.27□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.26□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A1B0GUT8 65 aa8.26□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 SMLR1H3BR10 107 aa8.26□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 PPP1R2P9O14990 202 aa8.26□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 AMN1Q8IY45 258 aa8.26□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 NRACQ8N912 160 aa8.26□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.25□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.25□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.24□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 TCAPO15273 167 aa8.24□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 BCE1O60756 84 aa8.24□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.24□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.24□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 C22orf24Q9Y442 160 aa8.24□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 SMKR1H3BMG3 65 aa8.23□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 HBBP68871 147 aa8.23□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.23□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.23□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 IFITM10A6NMD0 228 aa8.22□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 HIGD1CA8MV81 97 aa8.22□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.22□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 C2orf82Q6UX34 121 aa8.22□□□□□ -1.09
PRPF40A-211ENST00000493468 C20orf78Q9BR46 151 aa8.21□□□□□ -1.1
PRPF40A-211ENST00000493468 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.2□□□□□ -1.1
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF727A8MUV8 499 aa8.19□□□□□ -1.1
PRPF40A-211ENST00000493468 TMEM250H0YL14 139 aa8.19□□□□□ -1.1
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PRPF40A-211ENST00000493468 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.19□□□□□ -1.1
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PRPF40A-211ENST00000493468 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.18□□□□□ -1.1
PRPF40A-211ENST00000493468 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.18□□□□□ -1.1
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PRPF40A-211ENST00000493468 RIGQ13278 110 aa8.17□□□□□ -1.1
PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.17□□□□□ -1.1
PRPF40A-211ENST00000493468 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PRPF40A-211ENST00000493468 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.16□□□□□ -1.1
PRPF40A-211ENST00000493468 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.16□□□□□ -1.1
PRPF40A-211ENST00000493468 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.15□□□□□ -1.1
PRPF40A-211ENST00000493468 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PRPF40A-211ENST00000493468 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.15□□□□□ -1.1
PRPF40A-211ENST00000493468 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.14□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 OSTCQ9NRP0 149 aa8.14□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.14□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 PRSS2P07478 247 aa8.13□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 CKS1BP61024 79 aa8.13□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 LINC01551Q86U37 167 aa8.13□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 Q8IZM0 81 aa8.13□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.12□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 TNFRSF6BO95407 300 aa8.12□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 LINC00167Q96N53 147 aa8.12□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.12□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 CKS2P33552 79 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 UBE2AP49459 152 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 Q6ZN92 141 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 TMEM141Q96I45 108 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 RGS21Q2M5E4 152 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 V9GYV3 84 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 F8VRH5 84 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-211ENST00000493468 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A1B0GW15 77 aa8.08□□□□□ -1.12
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