RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.83□□□□□ -0.03
PSPC1-204ENST00000492741 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.83□□□□□ -0.03
PSPC1-204ENST00000492741 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.82□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.82□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa14.81□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.8□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 M0R2N4 97 aa14.8□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 CD164L2Q6UWJ8 174 aa14.8□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa14.8□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 GAGE12HA6NDE8 117 aa14.79□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 HSBP1L1C9JCN9 74 aa14.78□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 H3BRM9 83 aa14.78□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 C5orf38Q86SI9 138 aa14.78□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 RMI2Q96E14 147 aa14.78□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 SMIM6P0DI80 62 aa14.78□□□□□ -0.04
PSPC1-204ENST00000492741 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa14.77□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 hDV102S1A0JD36 115 aa14.77□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 STPG4Q8N801 248 aa14.77□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa14.76□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 CDPF1Q6NVV7 123 aa14.76□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 COX7A2LO14548 114 aa14.75□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 HERVK_113P61574 105 aa14.75□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 MAJINQ3KP22 176 aa14.75□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 MALP21145 153 aa14.75□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 FOXI1Q12951 378 aa14.75□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 VAMP8Q9BV40 100 aa14.75□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 SPINK8P0C7L1 97 aa14.74□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 S100A12P80511 92 aa14.74□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.73□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 A0A087WZ39 114 aa14.73□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM223A0PJW6 202 aa14.72□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 TM2D2Q9BX73 214 aa14.72□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.72□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 COX11Q9Y6N1 276 aa14.72□□□□□ -0.05
PSPC1-204ENST00000492741 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa14.7□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 PSCAO43653 123 aa14.69□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 C12orf57Q99622 126 aa14.69□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 DNAH1Q9P2D7 4330 aa14.69□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.69□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 SPATA45Q537H7 98 aa14.69□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.68□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.68□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 Q6ZR54 194 aa14.68□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa14.67□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 APOMO95445 188 aa14.67□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 E9PLD3 99 aa14.66□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 NMUP48645 174 aa14.66□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 LINC01561Q8N1V8 128 aa14.66□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 TOMM7Q9P0U1 55 aa14.66□□□□□ -0.06
PSPC1-204ENST00000492741 LEPROTO15243 131 aa14.64□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.64□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 C6orf223Q8N319 242 aa14.64□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.64□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa14.63□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 PLEKHB2Q96CS7 222 aa14.63□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.63□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 PRSS2P07478 247 aa14.63□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 CFAP161Q6P656 301 aa14.63□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.63□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 LCE6AA0A183 80 aa14.62□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.62□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 J3QQQ9 107 aa14.61□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 COX7B2Q8TF08 81 aa14.61□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.61□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 C6orf226Q5I0X4 101 aa14.61□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 KMT2AQ03164 3969 aa14.6□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 USP17L23D6RBM5 183 aa14.58□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa14.58□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 LECT2O14960 151 aa14.58□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 TSPEAR-AS2P59090 65 aa14.58□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 SPAG11BQ08648 103 aa14.58□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 HIGD2BQ4VC39 106 aa14.58□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 C14orf144Q96I85 54 aa14.58□□□□□ -0.07
PSPC1-204ENST00000492741 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PSPC1-204ENST00000492741 Q8IZM0 81 aa14.58□□□□□ -0.08
PSPC1-204ENST00000492741 C15orf56Q8N910 161 aa14.58□□□□□ -0.08
PSPC1-204ENST00000492741 PCP2Q8IVA1 136 aa14.57□□□□□ -0.08
PSPC1-204ENST00000492741 TTTY13Q9BZ97 58 aa14.57□□□□□ -0.08
PSPC1-204ENST00000492741 CKS1BP61024 79 aa14.55□□□□□ -0.08
PSPC1-204ENST00000492741 LINC00526Q96FQ7 95 aa14.55□□□□□ -0.08
PSPC1-204ENST00000492741 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.55□□□□□ -0.08
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF815PA8K554 130 aa14.55□□□□□ -0.08
PSPC1-204ENST00000492741 COX8AP10176 69 aa14.54□□□□□ -0.08
PSPC1-204ENST00000492741 PRO1933Q9H354 126 aa14.54□□□□□ -0.08
PSPC1-204ENST00000492741 KIAA0087Q14695 138 aa14.53□□□□□ -0.08
PSPC1-204ENST00000492741 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PSPC1-204ENST00000492741 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa14.52□□□□□ -0.09
PSPC1-204ENST00000492741 C2orf82Q6UX34 121 aa14.52□□□□□ -0.09
PSPC1-204ENST00000492741 CXCL5P42830 114 aa14.51□□□□□ -0.09
PSPC1-204ENST00000492741 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.51□□□□□ -0.09
PSPC1-204ENST00000492741 WFDC2Q14508 124 aa14.5□□□□□ -0.09
PSPC1-204ENST00000492741 NDUFA1O15239 70 aa14.49□□□□□ -0.09
PSPC1-204ENST00000492741 C14orf177Q52M58 125 aa14.49□□□□□ -0.09
PSPC1-204ENST00000492741 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PSPC1-204ENST00000492741 CAMK2N2Q96S95 79 aa14.49□□□□□ -0.09
PSPC1-204ENST00000492741 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.49□□□□□ -0.09
PSPC1-204ENST00000492741 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms