RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492403.1

EPHB4-208, Transcript of EPH receptor B4, humanhuman

TSL 2

Gene EPHB4, Length 812 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4-208ENST00000492403 PCP2Q8IVA1 136 aa7.22□□□□□ -1.25
EPHB4-208ENST00000492403 TMEM101Q96IK0 257 aa7.22□□□□□ -1.25
EPHB4-208ENST00000492403 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
EPHB4-208ENST00000492403 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.21□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 IGLL5B9A064 214 aa7.21□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 UBE2L6O14933 153 aa7.21□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 DEFB4AO15263 64 aa7.21□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 HIST1H4GQ99525 98 aa7.21□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.21□□□□□ -1.26
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EPHB4-208ENST00000492403 LYRM9A8MSI8 78 aa7.2□□□□□ -1.26
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EPHB4-208ENST00000492403 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.2□□□□□ -1.26
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EPHB4-208ENST00000492403 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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EPHB4-208ENST00000492403 P0DMU3 169 aa7.19□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 FAM231AP0DMU4 169 aa7.19□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 FAM231CP0DMU5 169 aa7.19□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.19□□□□□ -1.26
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EPHB4-208ENST00000492403 CEND1Q8N111 149 aa7.19□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 AMELXQ99217 191 aa7.19□□□□□ -1.26
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EPHB4-208ENST00000492403 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.18□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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EPHB4-208ENST00000492403 TMEM243Q9BU79 118 aa7.18□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.17□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.17□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.17□□□□□ -1.26
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EPHB4-208ENST00000492403 HERVK_113P63121 156 aa7.17□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.17□□□□□ -1.26
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EPHB4-208ENST00000492403 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.17□□□□□ -1.26
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EPHB4-208ENST00000492403 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.16□□□□□ -1.26
EPHB4-208ENST00000492403 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.16□□□□□ -1.26
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EPHB4-208ENST00000492403 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.14□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 EMP1P54849 157 aa7.14□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 KRTAP10-2P60368 255 aa7.14□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 Q8NAQ8 132 aa7.14□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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EPHB4-208ENST00000492403 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 CCL25O15444 150 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.13□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 Q6ZTC4 211 aa7.13□□□□□ -1.27
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EPHB4-208ENST00000492403 UBE2D1P51668 147 aa7.12□□□□□ -1.27
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EPHB4-208ENST00000492403 SFTA2Q6UW10 78 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 LYSTQ99698 3801 aa7.12□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.11□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 DAD1P61803 113 aa7.11□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.11□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.11□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.11□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 APLNQ9ULZ1 77 aa7.11□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 TIMM17BO60830 172 aa7.1□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 HTN3P15516 51 aa7.1□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 SEC61GP60059 68 aa7.1□□□□□ -1.27
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