RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 ENHOQ6UWT2 76 aa7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 KLK12Q9UKR0 248 aa7.76□□□□□ -1.17
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C9orf3-220ENST00000489318 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 LEPROTO15243 131 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 NMUP48645 174 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 MIAQ16674 131 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 MUC7Q8TAX7 377 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 A0A087WZ39 114 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 CRPP02741 224 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 PCP2Q8IVA1 136 aa7.74□□□□□ -1.17
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C9orf3-220ENST00000489318 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.74□□□□□ -1.17
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C9orf3-220ENST00000489318 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 J3QQQ9 107 aa7.73□□□□□ -1.17
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C9orf3-220ENST00000489318 DDTP30046 118 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 XCL1P47992 114 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 FOXI1Q12951 378 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.72□□□□□ -1.17
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C9orf3-220ENST00000489318 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 Q9H8V8 135 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-220ENST00000489318 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.71□□□□□ -1.18
C9orf3-220ENST00000489318 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.71□□□□□ -1.18
C9orf3-220ENST00000489318 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.71□□□□□ -1.18
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C9orf3-220ENST00000489318 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.7□□□□□ -1.18
C9orf3-220ENST00000489318 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.69□□□□□ -1.18
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C9orf3-220ENST00000489318 ZNF815PA8K554 130 aa7.69□□□□□ -1.18
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C9orf3-220ENST00000489318 HIGD1BQ9P298 99 aa7.69□□□□□ -1.18
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C9orf3-220ENST00000489318 C5orf38Q86SI9 138 aa7.68□□□□□ -1.18
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C9orf3-220ENST00000489318 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
C9orf3-220ENST00000489318 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.67□□□□□ -1.18
C9orf3-220ENST00000489318 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.67□□□□□ -1.18
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C9orf3-220ENST00000489318 TTC32Q5I0X7 151 aa7.66□□□□□ -1.18
C9orf3-220ENST00000489318 CASC10Q5T4H9 136 aa7.66□□□□□ -1.18
C9orf3-220ENST00000489318 SFTA2Q6UW10 78 aa7.66□□□□□ -1.18
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00587B1AMM8 73 aa7.65□□□□□ -1.18
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C9orf3-220ENST00000489318 KIAA0087Q14695 138 aa7.65□□□□□ -1.18
C9orf3-220ENST00000489318 RMI2Q96E14 147 aa7.65□□□□□ -1.18
C9orf3-220ENST00000489318 TGP01266 2768 aa7.64□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.64□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 A0A0J9YXY3 114 aa7.64□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.64□□□□□ -1.19
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C9orf3-220ENST00000489318 CXCL5P42830 114 aa7.64□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 HERV-K104P63124 156 aa7.64□□□□□ -1.19
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C9orf3-220ENST00000489318 COX11Q9Y6N1 276 aa7.64□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 TIMM17BO60830 172 aa7.63□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 TAL2Q16559 108 aa7.63□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.63□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 C15orf56Q8N910 161 aa7.63□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 LITAFQ99732 161 aa7.63□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 Q9HAA7 133 aa7.63□□□□□ -1.19
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C9orf3-220ENST00000489318 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 CTAG1AP78358 180 aa7.62□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 HSD52Q0P140 79 aa7.62□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.62□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.62□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM238C9JI98 176 aa7.61□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 PRSS2P07478 247 aa7.61□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 SPAG11BQ08648 103 aa7.61□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.61□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 CFAP161Q6P656 301 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZR54 194 aa7.6□□□□□ -1.19
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