RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 C10orf82Q8WW14 230 aa-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 SPRR4Q96PI1 79 aa-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 BOLA2Q9H3K6 86 aa-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 PXDNQ92626 1479 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 ATMQ13315 3056 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 PARP14Q460N5 1801 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 PATJQ8NI35 1801 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 MYH3P11055 1940 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 FAM107AO95990 144 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 TCRAP04437 139 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 NEFHP12036 1026 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 PSPHP78330 225 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 C10orf113Q5VZT2 155 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 THEM6Q8WUY1 208 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 LENEPQ9Y5L5 61 aa-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 MYH1P12882 1939 aa-1.13□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 SIX6O95475 246 aa-1.13□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-1.13□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 LINC01600Q96MT4 127 aa-1.13□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 AQP10Q96PS8 301 aa-1.13□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 SELENOSQ9BQE4 189 aa-1.13□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 PRO1933Q9H354 126 aa-1.13□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 FAIMQ9NVQ4 179 aa-1.13□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 V9GYQ6 96 aa-1.13□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-1.13□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 DISP2A7MBM2 1401 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 CLIP1P30622 1438 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 DAPK1P53355 1430 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 HCG22E2RYF7 251 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 SNCAP37840 140 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 SEC11AP67812 179 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 PRLHP81277 87 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 C10orf128Q5T292 105 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 LELP1Q5T871 98 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 LINC01545Q5VT33 79 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 COPZ2Q9P299 210 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-1.14□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 A0A0G2JMZ2 1700 aa-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 SYNMO15061 1565 aa-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 TMEM238C9JI98 176 aa-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 SFT2D2O95562 160 aa-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 UBE2G1P62253 170 aa-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 CCL8P80075 99 aa-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 TAC4Q86UU9 113 aa-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 PSENENQ9NZ42 101 aa-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 PRDM2Q13029 1718 aa-1.15□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 ZNF236Q9UL36 1845 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 IGLC7A0M8Q6 106 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 E7EQ34 232 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 SMIM24O75264 130 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 CBLN1P23435 193 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 NMSQ5H8A3 153 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 CLLU1Q5K131 121 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 GID8Q9NWU2 228 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 CALML5Q9NZT1 146 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-1.16□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 KDM5CP41229 1560 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 NLRP1Q9C000 1473 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 A0A1B0GU69 56 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 FAM223BA6NKX1 122 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 PFDN1O60925 122 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 SNCGO76070 127 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 TNP1P09430 55 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 C5orf38Q86SI9 138 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 TTC9CQ8N5M4 171 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 PP6455Q8WZ26 134 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 CCDC115Q96NT0 180 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 SEC11CQ9BY50 192 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-1.17□□□□□ -2.6
SENP6-210ENST00000487548 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-1.17□□□□□ -2.6
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