RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 PSCAO43653 123 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 XCL1P47992 114 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 KRTDAPP60985 99 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 LINC01545Q5VT33 79 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 A0A0J9YXV3 536 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 H0Y8G0 127 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 H3BRM9 83 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 COX7A2LO14548 114 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 FOXI1Q12951 378 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 A0A087WZ39 114 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 DPM2O94777 84 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 APOMO95445 188 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 CFAP161Q6P656 301 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 KMT2AQ03164 3969 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 IGKCP01834 107 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 C11orf86A6NJI1 115 aa8.66□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 MALP21145 153 aa8.66□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 COX6A2Q02221 97 aa8.66□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 C14orf177Q52M58 125 aa8.66□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.65□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.65□□□□□ -1.02
NISCH-208ENST00000481211 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 F8WDY8 70 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 C5orf38Q86SI9 138 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 EREGO14944 169 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 HERVK_113P61574 105 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 TMEM223A0PJW6 202 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 USP17L23D6RBM5 183 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 RTL8CO15255 209 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 SCGB1D1O95968 90 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 A0A087WTM6 91 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 SFTA2Q6UW10 78 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 Q8IZM0 81 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 C15orf56Q8N910 161 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 SPINK8P0C7L1 97 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 CXCL5P42830 114 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 C2orf48Q96LS8 159 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-208ENST00000481211 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 PRSS2P07478 247 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 SPAG11BQ08648 103 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 hDV102S1A0JD36 115 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 E9PLD3 99 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 Q8N814 137 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 COX7B2Q8TF08 81 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 LCE2BO14633 110 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 LEPROTO15243 131 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 NMUP48645 174 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 TNP2Q05952 138 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 KIAA0087Q14695 138 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 LECT2O14960 151 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 NDUFA1O15239 70 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 CKS1BP61024 79 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 WFDC2Q14508 124 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 PYY3Q5JQD4 70 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 ATOH7Q8N100 152 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 STPG4Q8N801 248 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-208ENST00000481211 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 DNAH2Q9P225 4427 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 J3QQQ9 107 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 SMIM6P0DI80 62 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
NISCH-208ENST00000481211 HERV-K104P63124 156 aa8.52□□□□□ -1.05
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