RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471643.1

RALGPS1-211, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 681 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-211ENST00000471643 CCL20P78556 96 aa8.27□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 KIAA0087Q14695 138 aa8.27□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 FAM104AQ969W3 186 aa8.27□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 C22orf24Q9Y442 160 aa8.26□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.25□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.25□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 BCE1O60756 84 aa8.23□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.23□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.23□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.23□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 GNG13Q9P2W3 67 aa8.23□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 CTAG1AP78358 180 aa8.22□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 MT1HP80294 61 aa8.22□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 C2orf82Q6UX34 121 aa8.22□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.22□□□□□ -1.09
RALGPS1-211ENST00000471643 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.21□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 UMAD1C9J7I0 102 aa8.21□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.21□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.21□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 MANBALQ9NQG1 85 aa8.21□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 K7EN84 100 aa8.2□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 ARPC5O15511 151 aa8.2□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 FCER1GP30273 86 aa8.2□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.2□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 BIN3Q9NQY0 253 aa8.2□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 VCYO14598 125 aa8.19□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 RAB4AP20338 218 aa8.19□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 SMKR1H3BMG3 65 aa8.18□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.18□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.18□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.18□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 NRACQ8N912 160 aa8.17□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.17□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 MED9Q9NWA0 146 aa8.17□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF727A8MUV8 499 aa8.16□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 OCC1Q8TAD7 63 aa8.16□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.16□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.15□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 PDE6DO43924 150 aa8.15□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 AMN1Q8IY45 258 aa8.15□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.15□□□□□ -1.1
RALGPS1-211ENST00000471643 CFC1BP0CG36 223 aa8.14□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.13□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 LINC00167Q96N53 147 aa8.13□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 KIR2DL4Q99706 377 aa8.13□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 IFITM10A6NMD0 228 aa8.12□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.12□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 TMEM18Q96B42 140 aa8.12□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.12□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.11□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 A8MWL6 223 aa8.1□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 SMLR1H3BR10 107 aa8.1□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 HBBP68871 147 aa8.1□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 A0A1B0GUT8 65 aa8.09□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF345Q14585 488 aa8.09□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.09□□□□□ -1.11
RALGPS1-211ENST00000471643 UBE2AP49459 152 aa8.08□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.08□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 GAGE10A6NGK3 116 aa8.07□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 HIGD1CA8MV81 97 aa8.07□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 PPP1R17O96001 155 aa8.07□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.07□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 PPP1R2P9O14990 202 aa8.06□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 CT83Q5H943 113 aa8.06□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 BORCS7Q96B45 105 aa8.06□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 SSPOA2VEC9 5147 aa8.06□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.05□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.04□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 PRLHP81277 87 aa8.04□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.04□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 C20orf78Q9BR46 151 aa8.04□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 CKS1BP61024 79 aa8.03□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.03□□□□□ -1.12
RALGPS1-211ENST00000471643 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.02□□□□□ -1.13
RALGPS1-211ENST00000471643 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.02□□□□□ -1.13
RALGPS1-211ENST00000471643 TNFRSF6BO95407 300 aa8.02□□□□□ -1.13
RALGPS1-211ENST00000471643 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.02□□□□□ -1.13
RALGPS1-211ENST00000471643 USH2AO75445 5202 aa8.02□□□□□ -1.13
RALGPS1-211ENST00000471643 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.01□□□□□ -1.13
RALGPS1-211ENST00000471643 TEX46H3BTG2 121 aa8.01□□□□□ -1.13
RALGPS1-211ENST00000471643 TCAPO15273 167 aa8.01□□□□□ -1.13
RALGPS1-211ENST00000471643 PRSS2P07478 247 aa8.01□□□□□ -1.13
RALGPS1-211ENST00000471643 Q8IZM0 81 aa8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms