RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468018.5

ATG4B-215, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-215ENST00000468018 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 C5orf38Q86SI9 138 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 CARD19Q96LW7 228 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 LINC01546A6NGU7 62 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 IFITM10A6NMD0 228 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 MALP21145 153 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 S100PP25815 95 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 SYCNQ0VAF6 134 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 COX19Q49B96 90 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 TMEM141Q96I45 108 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 C2orf48Q96LS8 159 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 AMELXQ99217 191 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG4B-215ENST00000468018 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 A0A096LNI7 61 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 IGIPA6NJ69 53 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 Q6ZRU5 148 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 APOMO95445 188 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 UBE2D1P51668 147 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 HERC1Q15751 4861 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 MT-ND6P03923 174 aa9.56□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.56□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 A0A087WZ39 114 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 SPAG11BQ08648 103 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 MAJINQ3KP22 176 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 TOMM6Q96B49 74 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 F8WDY8 70 aa9.54□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 RNF151Q2KHN1 245 aa9.54□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.54□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.54□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 TIMM17AQ99595 171 aa9.54□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 G0S2P27469 103 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 PTTG1IPP53801 180 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 KIAA0087Q14695 138 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ATG4B-215ENST00000468018 APOC3P02656 99 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 Q6ZN92 141 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 STPG4Q8N801 248 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 DPH3Q96FX2 82 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 SNAPINO95295 136 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 SVBPQ8N300 66 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 VCX2Q9H322 139 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 ERASQ7Z444 233 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 LINC01549A6NIU2 74 aa9.49□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.49□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.49□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 C10orf25Q5T742 122 aa9.49□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 YPEL4Q96NS1 127 aa9.49□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 NDUFA1O15239 70 aa9.48□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 NDUFA5Q16718 116 aa9.48□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.48□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.48□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 A0A0J9YXV3 536 aa9.47□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 GAGE2BQ13066 116 aa9.47□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 C7orf33Q8WU49 177 aa9.47□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.47□□□□□ -0.89
ATG4B-215ENST00000468018 A0A096LNJ9 63 aa9.46□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 A0A1W2PNN7 141 aa9.46□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 OXTP01178 125 aa9.46□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 HERVK_113P63121 156 aa9.46□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 SEC11AP67812 179 aa9.46□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.46□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.46□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.46□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.45□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.44□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.44□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 Q6ZRP5 223 aa9.44□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 FA2HQ7L5A8 372 aa9.44□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 J3QL48 77 aa9.43□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 C2orf82Q6UX34 121 aa9.43□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 Q8IZM0 81 aa9.43□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 SMCO4Q9NRQ5 59 aa9.43□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.42□□□□□ -0.9
ATG4B-215ENST00000468018 CST9LQ9H4G1 147 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms