RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	SEC11A	P67812	179 aa		5.51	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		5.51	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		5.51	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		5.51	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710		Q8N814	137 aa		5.51	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		5.51	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		5.51	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		5.51	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		5.5	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		5.5	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.5	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	HERVK_113	P63121	156 aa		5.5	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	LYST	Q99698	3801 aa		5.5	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		5.49	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	KRTAP10-2	P60368	255 aa		5.49	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		5.49	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		5.49	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	KMT2A	Q03164	3969 aa		5.48	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		5.48	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		5.48	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710		A0A1B0GVY2	172 aa		5.48	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	S100A2	P29034	98 aa		5.48	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		5.48	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		5.48	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		5.48	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		5.48	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		5.47	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710		A0A087WZ39	114 aa		5.47	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		5.47	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	C16orf90	A8MZG2	172 aa		5.47	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710		H3BRM9	83 aa		5.47	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	PRSS2	P07478	247 aa		5.47	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		5.47	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		5.47	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	C15orf56	Q8N910	161 aa		5.47	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	RYR3	Q15413	4870 aa		5.47	□□□□□ -1.53
IL6-208	ENST00000464710	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		5.46	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	IGLC3	P0DOY3	106 aa		5.46	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	GCSH	P23434	173 aa		5.46	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	KRTDAP	P60985	99 aa		5.46	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	SPAG11B	Q08648	103 aa		5.46	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		5.46	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		5.46	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		5.46	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710		F8VRH5	84 aa		5.45	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	SPINK8	P0C7L1	97 aa		5.45	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	LINC01620	Q4KN68	170 aa		5.45	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		5.45	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		5.45	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		5.45	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	DPH3	Q96FX2	82 aa		5.45	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		5.45	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	C11orf86	A6NJI1	115 aa		5.44	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		5.44	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	SLPI	P03973	132 aa		5.44	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	CKS1B	P61024	79 aa		5.44	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	SYCN	Q0VAF6	134 aa		5.44	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		5.44	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	NDUFA1	O15239	70 aa		5.43	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	DPM2	O94777	84 aa		5.43	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	IGKC	P01834	107 aa		5.43	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	C3orf79	P0CE67	100 aa		5.43	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	ODF1	Q14990	250 aa		5.43	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	PET117	Q6UWS5	81 aa		5.43	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		5.43	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		5.43	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		5.43	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	COX7B2	Q8TF08	81 aa		5.43	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	C2orf48	Q96LS8	159 aa		5.43	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		5.42	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		5.42	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	C2orf82	Q6UX34	121 aa		5.42	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710		Q6ZRU5	148 aa		5.42	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	CARD19	Q96LW7	228 aa		5.42	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	TMEM223	A0PJW6	202 aa		5.41	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	C20orf202	A1L168	122 aa		5.41	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	C5orf52	A6NGY3	159 aa		5.41	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710		F8WDY8	70 aa		5.41	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	PLN	P26678	52 aa		5.41	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	KRTAP10-1	P60331	282 aa		5.41	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	KIAA0087	Q14695	138 aa		5.41	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710		Q8IZM0	81 aa		5.41	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		5.41	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	HERVK_113	P61574	105 aa		5.4	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	GAGE2B	Q13066	116 aa		5.4	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	C10orf25	Q5T742	122 aa		5.4	□□□□□ -1.54
IL6-208	ENST00000464710	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		5.39	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	LINC01545	Q5VT33	79 aa		5.39	□□□□□ -1.55
IL6-208	ENST00000464710	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		5.39	□□□□□ -1.55

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