RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 DNAH8Q96JB1 4490 aa11.92□□□□□ -0.5
DDR1-241ENST00000460944 PCLOQ9Y6V0 5065 aa11.91□□□□□ -0.5
DDR1-241ENST00000460944 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa11.91□□□□□ -0.5
DDR1-241ENST00000460944 Q6ZSA8 131 aa11.91□□□□□ -0.5
DDR1-241ENST00000460944 AMELXQ99217 191 aa11.91□□□□□ -0.5
DDR1-241ENST00000460944 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.91□□□□□ -0.5
DDR1-241ENST00000460944 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.9□□□□□ -0.5
DDR1-241ENST00000460944 LINC00614P0C842 121 aa11.9□□□□□ -0.5
DDR1-241ENST00000460944 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.89□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 SLPIP03973 132 aa11.89□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 UBE2D1P51668 147 aa11.89□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 HAMPP81172 84 aa11.89□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.89□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 LINC00173Q6ZV60 143 aa11.89□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa11.88□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 SEC11AP67812 179 aa11.87□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 HBDP02042 147 aa11.86□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 SPAG11BQ08648 103 aa11.86□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 Q8N1X5 172 aa11.86□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 OR10D4PQ8NGN7 298 aa11.86□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.86□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa11.86□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 CARD19Q96LW7 228 aa11.86□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.85□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 TRGC2P03986 189 aa11.85□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 SYCNQ0VAF6 134 aa11.85□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 SDIM1Q6ZPB5 146 aa11.85□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 ORAOV1Q8WV07 137 aa11.85□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 PKIGQ9Y2B9 76 aa11.85□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 A0A087WZ39 114 aa11.84□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 CAMK2N2Q96S95 79 aa11.84□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.84□□□□□ -0.51
DDR1-241ENST00000460944 COLCA2A8K830 154 aa11.83□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 HERVK_113P63121 156 aa11.83□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 COX6A2Q02221 97 aa11.83□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 SCXQ7RTU7 201 aa11.83□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa11.83□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 C2orf48Q96LS8 159 aa11.83□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 A0A096LNJ9 63 aa11.82□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 PMCHL1Q16048 86 aa11.82□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 BAGE3Q86Y29 109 aa11.82□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 LINC01561Q8N1V8 128 aa11.82□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 PMVKQ15126 192 aa11.81□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 SCO1O75880 301 aa11.8□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 ATP5LO75964 103 aa11.8□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 CST9LQ9H4G1 147 aa11.8□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 A0A0J9YXV3 536 aa11.79□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 EPM2AB3EWF7 344 aa11.79□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 F8WDY8 70 aa11.79□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 NDUFA6P56556 154 aa11.79□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 Q6ZRU5 148 aa11.79□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa11.79□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 DPH3Q96FX2 82 aa11.79□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 FAM229AH3BQW9 127 aa11.78□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 NDUFA1O15239 70 aa11.78□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 HSBP1O75506 76 aa11.78□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 PDZD11Q5EBL8 140 aa11.78□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 LINC00469Q8N7U9 141 aa11.78□□□□□ -0.52
DDR1-241ENST00000460944 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa11.77□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 Q5VSD8 79 aa11.77□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.76□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 PRSS2P07478 247 aa11.76□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 CHTF8P0CG12 524 aa11.76□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa11.76□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.75□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 PANO1I0J062 215 aa11.75□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.75□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 TOMM7Q9P0U1 55 aa11.75□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 FAT1Q14517 4588 aa11.75□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 ABCA13Q86UQ4 5058 aa11.74□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 RNF151Q2KHN1 245 aa11.74□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 MAJINQ3KP22 176 aa11.74□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.74□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 LINC00474Q9P2X8 69 aa11.74□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa11.73□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 A0A096LNI7 61 aa11.73□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 KIAA0087Q14695 138 aa11.73□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa11.73□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 H3BRM9 83 aa11.72□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 SERF1AO75920 110 aa11.72□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 Q8IZM0 81 aa11.72□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 A0A087WYN8 130 aa11.71□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 IGLC3P0DOY3 106 aa11.71□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 CKS1BP61024 79 aa11.71□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.71□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.71□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 FAM19A2Q8N3H0 131 aa11.71□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 IFI27L1Q96BM0 104 aa11.71□□□□□ -0.53
DDR1-241ENST00000460944 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
DDR1-241ENST00000460944 S100A1P23297 94 aa11.7□□□□□ -0.54
DDR1-241ENST00000460944 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
DDR1-241ENST00000460944 GAGE2BQ13066 116 aa11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.3 ms