RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 KLLNB2CW77 178 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 PAX4O43316 350 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 BRK1Q8WUW1 75 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 SORL1Q92673 2214 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFC2O95298 119 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 PROK1P58294 105 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 AKAP6Q13023 2319 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 AVPP01185 164 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A087WYN8 130 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 NCR3O14931 201 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 GYPEP15421 78 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 COX6A2Q02221 97 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFHX3Q15911 3703 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 XCL1P47992 114 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 XCL2Q9UBD3 114 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 CR1P17927 2039 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 C8orf87E5RJ46 101 aa6.02□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.02□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.02□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 KNCNA6PVL3 124 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-11P01762 117 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 COPS9Q8WXC6 57 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 FSHBP01225 129 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 CRPP02741 224 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 SLPIP03973 132 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 HTN1P15515 57 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 SPTA1P02549 2419 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 ENHOQ6UWT2 76 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 LECT2O14960 151 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 SPINK13Q1W4C9 94 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00337Q8N6G1 96 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 H7BZZ5 65 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMB8P28062 276 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 LMO4P61968 165 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf95Q9H693 158 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 EPM2AB3EWF7 344 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFA4O00483 81 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 PDZD2O15018 2839 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 B4DSR2 109 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BUA1 57 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 SNURFQ9Y675 71 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZSN1 163 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV2D-28P01615 120 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 PRM2P04554 102 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 CCKP06307 115 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 RMI2Q96E14 147 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 C5orf56Q8N8D9 126 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 F8WEM9 126 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 SS18Q15532 418 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-203ENST00000439720 H0YGX0 51 aa5.95□□□□□ -1.46
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