RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 UQCC3Q6UW78 93 aa9.69□□□□□ -0.86
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SPC24-201ENST00000423327 IFITM10A6NMD0 228 aa9.68□□□□□ -0.86
SPC24-201ENST00000423327 PTTG1IPP53801 180 aa9.68□□□□□ -0.86
SPC24-201ENST00000423327 SPAG11BQ08648 103 aa9.68□□□□□ -0.86
SPC24-201ENST00000423327 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.68□□□□□ -0.86
SPC24-201ENST00000423327 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.68□□□□□ -0.86
SPC24-201ENST00000423327 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.68□□□□□ -0.86
SPC24-201ENST00000423327 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
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SPC24-201ENST00000423327 Q8N8P6 123 aa9.67□□□□□ -0.86
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SPC24-201ENST00000423327 C2orf82Q6UX34 121 aa9.56□□□□□ -0.88
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SPC24-201ENST00000423327 FAM168BA1KXE4 195 aa9.55□□□□□ -0.88
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SPC24-201ENST00000423327 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SPC24-201ENST00000423327 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC24-201ENST00000423327 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC24-201ENST00000423327 VCX2Q9H322 139 aa9.55□□□□□ -0.88
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SPC24-201ENST00000423327 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
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SPC24-201ENST00000423327 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.54□□□□□ -0.88
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SPC24-201ENST00000423327 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.52□□□□□ -0.89
SPC24-201ENST00000423327 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.52□□□□□ -0.89
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SPC24-201ENST00000423327 GAGE2EQ4V326 116 aa9.51□□□□□ -0.89
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SPC24-201ENST00000423327 LINC01600Q96MT4 127 aa9.51□□□□□ -0.89
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SPC24-201ENST00000423327 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.51□□□□□ -0.89
SPC24-201ENST00000423327 ODF1Q14990 250 aa9.5□□□□□ -0.89
SPC24-201ENST00000423327 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPC24-201ENST00000423327 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.5□□□□□ -0.89
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SPC24-201ENST00000423327 HERVK_113P63121 156 aa9.49□□□□□ -0.89
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SPC24-201ENST00000423327 COX19Q49B96 90 aa9.49□□□□□ -0.89
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