RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 COX6A2Q02221 97 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 PYY3Q5JQD4 70 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00469Q8N7U9 141 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.34□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BRM9 83 aa11.34□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.34□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa11.34□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAGE12HA6NDE8 117 aa11.33□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXI1Q12951 378 aa11.33□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZR54 194 aa11.33□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 TM2D2Q9BX73 214 aa11.33□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A087WZ39 114 aa11.32□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa11.32□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01561Q8N1V8 128 aa11.32□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 COX7A2LO14548 114 aa11.31□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATOH7Q8N100 152 aa11.31□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 TENM2Q9NT68 2774 aa11.31□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0R2N4 97 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM6P0DI80 62 aa11.3□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE6AA0A183 80 aa11.29□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM223A0PJW6 202 aa11.29□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 HERVK_113P61574 105 aa11.29□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 C5orf38Q86SI9 138 aa11.29□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 MALP21145 153 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 C6orf223Q8N319 242 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 STPG4Q8N801 248 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYSTQ99698 3801 aa11.28□□□□□ -0.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.27□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOMO95445 188 aa11.27□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPINK8P0C7L1 97 aa11.27□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 hDV102S1A0JD36 115 aa11.26□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSCAO43653 123 aa11.26□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 VAMP8Q9BV40 100 aa11.26□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAH1Q9P2D7 4330 aa11.25□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa11.25□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.25□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 E9PLD3 99 aa11.25□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.25□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS13DQ5THJ4 4388 aa11.24□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.24□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 S100A12P80511 92 aa11.24□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAJINQ3KP22 176 aa11.24□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFAP161Q6P656 301 aa11.24□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALMS1Q8TCU4 4167 aa11.23□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 LEPROTO15243 131 aa11.22□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.22□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDPF1Q6NVV7 123 aa11.22□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.22□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.22□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 ORAOV1Q8WV07 137 aa11.21□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAM16Q9Y3D7 125 aa11.21□□□□□ -0.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q8IZM0 81 aa11.2□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP17L23D6RBM5 183 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 J3QQQ9 107 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRSS2P07478 247 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA45Q537H7 98 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 C15orf56Q8N910 161 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 COX7B2Q8TF08 81 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.18□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 NMUP48645 174 aa11.18□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.18□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 C12orf57Q99622 126 aa11.18□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOMM7Q9P0U1 55 aa11.18□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa11.17□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPAG11BQ08648 103 aa11.17□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 SFTA2Q6UW10 78 aa11.17□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA0087Q14695 138 aa11.16□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 C14orf177Q52M58 125 aa11.16□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00518Q8N0U6 118 aa11.16□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 F8WDY8 70 aa11.16□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 CXCL5P42830 114 aa11.16□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.16□□□□□ -0.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.15□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 CKS1BP61024 79 aa11.15□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.15□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 C2orf48Q96LS8 159 aa11.15□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.15□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 LECT2O14960 151 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.13□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFA1O15239 70 aa11.13□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 COX8AP10176 69 aa11.13□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 HERV-K104P63124 156 aa11.12□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 WFDC2Q14508 124 aa11.12□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCP2Q8IVA1 136 aa11.12□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A087WTM6 91 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF815PA8K554 130 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 RTL8CO15255 209 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 DLEU1O43261 78 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAMK2N2Q96S95 79 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 C2orf82Q6UX34 121 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms