RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 DLEU1O43261 78 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 GAGE7O76087 117 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 GAGE12FP0CL80 117 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 GAGE12GP0CL81 117 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 GAGE12IP0CL82 117 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 LINC00694P0DN24 101 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 COX8AP10176 69 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 UBE2D3P61077 147 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 UBE2D2P62837 147 aa4.57□□□□□ -1.68
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CCL20-202ENST00000409189 C14orf144Q96I85 54 aa4.57□□□□□ -1.68
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CCL20-202ENST00000409189 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
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CCL20-202ENST00000409189 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.56□□□□□ -1.68
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CCL20-202ENST00000409189 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.56□□□□□ -1.68
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CCL20-202ENST00000409189 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 H7C423 109 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCL20-202ENST00000409189 HERVK_113P61574 105 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 NFE4Q86UQ8 179 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCL20-202ENST00000409189 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCL20-202ENST00000409189 C11orf86A6NJI1 115 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 SIVA1O15304 175 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.54□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 AMELXQ99217 191 aa4.54□□□□□ -1.68
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CCL20-202ENST00000409189 NMUP48645 174 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 EMP1P54849 157 aa4.53□□□□□ -1.68
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CCL20-202ENST00000409189 GAGE5Q13069 117 aa4.53□□□□□ -1.68
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CCL20-202ENST00000409189 TMEM243Q9BU79 118 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 VCX2Q9H322 139 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 HIGD1BQ9P298 99 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 PRO0255Q9UI72 69 aa4.53□□□□□ -1.68
CCL20-202ENST00000409189 RNF213Q63HN8 5207 aa4.52□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.52□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 UBE2L6O14933 153 aa4.52□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 ATP5G1P05496 136 aa4.52□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 DEFB130BP0DP73 79 aa4.52□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 DEFB130AP0DP74 79 aa4.52□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 DAD1P61803 113 aa4.52□□□□□ -1.69
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CCL20-202ENST00000409189 Q6ZUT4 128 aa4.52□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.52□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.52□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.51□□□□□ -1.69
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CCL20-202ENST00000409189 SEC11AP67812 179 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 Q9UF83 564 aa4.51□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
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