RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 MGPP08493 103 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 B2MP61769 119 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 MORN2Q502X0 79 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 GINS2Q9Y248 185 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 ACACAQ13085 2346 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 DISP2A7MBM2 1401 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 J3QR89 54 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 SFT2D2O95562 160 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGLC6P0CF74 106 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 C10orf113Q5VZT2 155 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAIMQ9NVQ4 179 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A0G2JMZ2 1700 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 AKAP13Q12802 2813 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 MGST2Q99735 147 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 DDA1Q9BW61 102 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 DNAH2Q9P225 4427 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 TCHHQ07283 1943 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 H3BNG1 76 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 FABP1P07148 127 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCNRGQ8N5I3 272 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPANXA1Q9NS26 97 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 PSME4Q14997 1843 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZZEF1O43149 2961 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-601P-201ENST00000384540 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 HMGN4O00479 90 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBE2D3P61077 147 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBE2D2P62837 147 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC01600Q96MT4 127 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMIM3Q9BZL3 60 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 CUBNO60494 3623 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYOM1P52179 1685 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 K7ERU9 68 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 AIF1LQ9BQI0 150 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC00694P0DN24 101 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 NEFHP12036 1026 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRO1933Q9H354 126 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 GSKIPQ9P0R6 139 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 DMXL1Q9Y485 3027 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 I3L3M4 83 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 M0R2Z0 102 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 C12orf73Q69YU5 71 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 AKAP14Q86UN6 197 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 TEX15Q9BXT5 2789 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 RYR2Q92736 4967 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARHGEF5Q12774 1597 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 TSPAN19P0C672 248 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 TSLPQ969D9 159 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 CRIPTQ9P021 101 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 LYSTQ99698 3801 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 FHAD1B1AJZ9 1412 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRANK1O15050 2925 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGLC1P0CG04 106 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 SEC11AP67812 179 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 BTG2P78543 158 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 HEPN1Q6WQI6 88 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 NUP188Q5SRE5 1749 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 COPS9Q8WXC6 57 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-601P-201ENST00000384540 TCEAL4Q96EI5 215 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-601P-201ENST00000384540 PDCD10Q9BUL8 212 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-601P-201ENST00000384540 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-601P-201ENST00000384540 DNAH11Q96DT5 4516 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCN7AQ01118 1682 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-601P-201ENST00000384540 DEFA5Q01523 94 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMCO1Q147U7 214 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM223AQ8IWN6 122 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPRR4Q96PI1 79 aa-1.67□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.3 ms