RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 UBE2D3P61077 147 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 UBE2D2P62837 147 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 UBE2D1P51668 147 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 BPTFQ12830 3046 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 KLLNB2CW77 178 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 Q8N9L7 120 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 C9orf85Q96MD7 179 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 PRR4Q16378 134 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 CRYGDP07320 174 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 PROK1P58294 105 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 LY6LH3BQJ8 138 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 MUC7Q8TAX7 377 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 EBI3Q14213 229 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 A0A0J9YWU9 116 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 IGIPA6NJ69 53 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 GAS8-AS1O95177 125 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 A0A096LNI7 61 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 Q8N814 137 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 PRR9Q5T870 116 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV2D-28P01615 120 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 Q8IZM0 81 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 M0R378 163 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 A0A087WZ39 114 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 NRGNQ92686 78 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 LMO4P61968 165 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRT-204ENST00000373190 SYCNQ0VAF6 134 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 J3QKU1 62 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 PRYO14603 147 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 CELA1Q9UNI1 258 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 A0A087WVE0 104 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 Q6YL49 198 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 USP24Q9UPU5 2620 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 POLQO75417 2590 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 Q8N3U1 123 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 PCSK5Q92824 1860 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 Q8NA96 180 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 A0A087WYN8 130 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 CDIP1Q9H305 208 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 PSPHP1O15172 72 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 PRO0628Q9UI54 55 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 LELP1Q5T871 98 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 Q8N6K4 173 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 RETNQ9HD89 108 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-204ENST00000373190 C10orf25Q5T742 122 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 WISP2O76076 250 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZSV7 163 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 PRORYQ9H606 182 aa6.39□□□□□ -1.39
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