RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363613.1

RNU6-1017P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1017, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1017P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1017P-201ENST00000363613 Q9H8V8 135 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LEPROTO15243 131 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PRSS2P07478 247 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NMUP48645 174 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ATOH7Q8N100 152 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C1orf43Q9BWL3 253 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PRR34Q9NV39 138 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TMEM223A0PJW6 202 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 E9PLD3 99 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DLEU1O43261 78 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 COPS9Q8WXC6 57 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1017P-201ENST00000363613 A0A087WZ39 114 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 hDV102S1A0JD36 115 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 F8WDY8 70 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 J3QQQ9 107 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 COX8AP10176 69 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 XCL1P47992 114 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZFAND6Q6FIF0 208 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 STPG4Q8N801 248 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CXCL5P42830 114 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 HERV-K104P63124 156 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FAM104AQ969W3 186 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNF815PA8K554 130 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PSCAO43653 123 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SPINK8P0C7L1 97 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CKS1BP61024 79 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C14orf177Q52M58 125 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ENHOQ6UWT2 76 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C5orf38Q86SI9 138 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 COX7B2Q8TF08 81 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C14orf144Q96I85 54 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 COX6A2Q02221 97 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 Q6ZVH6 145 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 Q8IZM0 81 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PRO1933Q9H354 126 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 Q9HAA7 133 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TMEM238C9JI98 176 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CASC10Q5T4H9 136 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 HIGD1BQ9P298 99 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 M0R143 59 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NDUFA1O15239 70 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DDTP30046 118 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FOXI1Q12951 378 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TAL2Q16559 108 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MAJINQ3KP22 176 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C2orf48Q96LS8 159 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1017P-201ENST00000363613 A0A0J9YXY3 114 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 A6NJY4 79 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 EREGO14944 169 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TIMM17BO60830 172 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LY6G6CO95867 125 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 HIST1H4GQ99525 98 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IFITM1P13164 125 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SPAG11BQ08648 103 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 HSD52Q0P140 79 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1017P-201ENST00000363613 COX17Q14061 63 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.1 ms