RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 ORMDL2Q53FV1 153 aa12.41□□□□□ -0.42
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PTPRCAP-201ENST00000326294 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYSLTR1Q9Y271 337 aa12.41□□□□□ -0.42
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PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa12.4□□□□□ -0.42
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PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC01546A6NGU7 62 aa12.31□□□□□ -0.44
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PTPRCAP-201ENST00000326294 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC01561Q8N1V8 128 aa12.26□□□□□ -0.45
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PTPRCAP-201ENST00000326294 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa12.25□□□□□ -0.45
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SCGB3A1Q96QR1 104 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf48Q9UBA6 75 aa12.25□□□□□ -0.45
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PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR3P79522 188 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
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PTPRCAP-201ENST00000326294 OXTP01178 125 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZRP5 223 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q8IZM0 81 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 CST9LQ9H4G1 147 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOMM7Q9P0U1 55 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa12.16□□□□□ -0.46
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