RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 MANBALQ9NQG1 85 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM168BA1KXE4 195 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB19A4D1S5 217 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R17O96001 155 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC51BQ86UW2 128 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM213BQ8TBF2 198 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 CNFNQ9BYD5 112 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL20P78556 96 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR2DL4Q99706 377 aa4.62□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GV50 99 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 VCYO14598 125 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 TCAPO15273 167 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 TSHBP01222 138 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf52Q96A22 123 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.61□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE6DO43924 150 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 S100A6P06703 90 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.6□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087X002 238 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R2P9O14990 202 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 BCE1O60756 84 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT11Q96G61 164 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 GNG13Q9P2W3 67 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.59□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 A8MWL6 223 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 MED9Q9NWA0 146 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC17Q685J3 4493 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 ARPC5O15511 151 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS2P07478 247 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 CFC1BP0CG36 223 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 HBBP68871 147 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 C22orf24Q9Y442 160 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.57□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 IFITM10A6NMD0 228 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2AP49459 152 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 CKS1BP61024 79 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf25Q5T742 122 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZUT4 128 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 SVIPQ8NHG7 77 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF727A8MUV8 499 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 GATCO43716 136 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 S100A12P80511 92 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 IFITM3Q01628 133 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 Q5BKY6 102 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GUT8 65 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF345Q14585 488 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB4AP20338 218 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS21Q2M5E4 152 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 CT83Q5H943 113 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-201ENST00000296642 C20orf78Q9BR46 151 aa4.52□□□□□ -1.69
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