RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.12□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa11.12□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa11.12□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 Q6ZTI0 123 aa11.12□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.11□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 HAMPP81172 84 aa11.11□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 IGLV1-40P01703 118 aa11.11□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 TRACP01848 142 aa11.11□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 MALP21145 153 aa11.11□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 WFDC9Q8NEX5 89 aa11.11□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 PSMB8P28062 276 aa11.1□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 CFAP161Q6P656 301 aa11.1□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 A0A087WVE0 104 aa11.1□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 NCR3O14931 201 aa11.1□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.1□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.09□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 LITAFQ99732 161 aa11.09□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 M0QXV9 152 aa11.09□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
USP25-201ENST00000285679 UQCRQO14949 82 aa11.08□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 S100A7L2Q5SY68 101 aa11.08□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa11.08□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 TMEM86BQ8N661 226 aa11.08□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.07□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 DEFB4AO15263 64 aa11.07□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 COX7B2Q8TF08 81 aa11.07□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 FAM110AQ9BQ89 295 aa11.07□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.07□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.06□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 K7EQD1 137 aa11.06□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.06□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 VPREB3Q9UKI3 123 aa11.05□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa11.05□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.05□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.05□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.05□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 ATOX1O00244 68 aa11.05□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 PLA2G2AP14555 144 aa11.05□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.05□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 FAM218AQ96MZ4 157 aa11.04□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 FBN2P35556 2912 aa11.04□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 J3KT08 172 aa11.03□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 NF1P21359 2839 aa11.03□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.03□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 SMCR5Q8TEV8 140 aa11.02□□□□□ -0.64
USP25-201ENST00000285679 A0A087WYN8 130 aa11.02□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.02□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 TEX15Q9BXT5 2789 aa11.02□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 TIMM17BO60830 172 aa11.01□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.01□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 ORMDL1Q9P0S3 153 aa11.01□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 DSCR8Q96T75 97 aa11□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 BSNQ9UPA5 3926 aa10.99□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 COX7CP15954 63 aa10.99□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 RNF152Q8N8N0 203 aa10.99□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa10.99□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 IMUPQ9GZP8 106 aa10.99□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 HECTD1Q9ULT8 2610 aa10.98□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 SCXQ7RTU7 201 aa10.98□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 CFAP46Q8IYW2 2715 aa10.98□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 TMEM89A2RUT3 159 aa10.98□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 LINC00337Q8N6G1 96 aa10.98□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 H0YGX0 51 aa10.96□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 PF4P02776 101 aa10.96□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 C20orf197Q8N268 126 aa10.96□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 UBL5Q9BZL1 73 aa10.96□□□□□ -0.65
USP25-201ENST00000285679 CXCL5P42830 114 aa10.96□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa10.96□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 USP17L23D6RBM5 183 aa10.95□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 GHRHP01286 108 aa10.95□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 CCL18P55774 89 aa10.95□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 SS18Q15532 418 aa10.95□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 LINC00846Q9NV44 126 aa10.95□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 ITPR3Q14573 2671 aa10.94□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 DAD1P61803 113 aa10.94□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.94□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 ENHOQ6UWT2 76 aa10.94□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 KLK9Q2XQG4 91 aa10.93□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.92□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 ATRQ13535 2644 aa10.92□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 Q96MF0 132 aa10.92□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa10.92□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 GYPEP15421 78 aa10.92□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 HILS1P60008 231 aa10.92□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 TRAV25A0A0B4J276 109 aa10.91□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa10.91□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 A8MTW9 85 aa10.91□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 CCL24O00175 119 aa10.91□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa10.91□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 ZNF702PQ9H963 129 aa10.91□□□□□ -0.66
USP25-201ENST00000285679 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96 ms