RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.66□□□□□ -1.02
UBASH3B-201ENST00000284273 Q6ZSR3 168 aa8.66□□□□□ -1.02
UBASH3B-201ENST00000284273 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
UBASH3B-201ENST00000284273 PRO3102Q9H379 93 aa8.65□□□□□ -1.02
UBASH3B-201ENST00000284273 M0R378 163 aa8.65□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 Q6ZPA2 131 aa8.65□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 CELA1Q9UNI1 258 aa8.65□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.65□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 COX6A2Q02221 97 aa8.64□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.64□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 H7C423 109 aa8.64□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 PRYO14603 147 aa8.64□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 ODF3Q96PU9 254 aa8.64□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.63□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.63□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 NDUFC2O95298 119 aa8.63□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 GAS8-AS1O95177 125 aa8.63□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.62□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 TSHBP01222 138 aa8.62□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIAP1O43715 76 aa8.62□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.62□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.62□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.62□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 REG3GQ6UW15 175 aa8.62□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 MBD6Q96DN6 1003 aa8.62□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 TAX1BP3O14907 124 aa8.61□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 IGLC6P0CF74 106 aa8.61□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 ADAMTS20P59510 1910 aa8.61□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF185Q96GF1 192 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 PRR15LQ9BU68 103 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-201ENST00000284273 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 PCOTHQ58A44 107 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 AGRNO00468 2067 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 Q8N9L7 120 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 SERP2Q8N6R1 65 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 PDE6GP18545 87 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 IGLV1-40P01703 118 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 MDFIQ99750 246 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 PRLHP81277 87 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 H3BT86 120 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 HIGD1BQ9P298 99 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 A8MTW9 85 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 C2orf48Q96LS8 159 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PPR1 153 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 EBI3Q14213 229 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 A6NED7 52 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC168Q8NDH2 2452 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 TTC28Q96AY4 2481 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 MT-ATP8P03928 68 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 CHTF8P0CG12 524 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 Q9BRP9 147 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 EML5Q05BV3 1969 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 ACACBO00763 2458 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 LST1O00453 97 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00694P0DN24 101 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1B0GXF2 115 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 J3KT08 172 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 J3QL48 77 aa8.52□□□□□ -1.04
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.52□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 Q8N6K4 173 aa8.52□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.52□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.52□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 TIMM17BO60830 172 aa8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 P0C879 139 aa8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00643Q86TS7 51 aa8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.51□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 IGLV1-51P01701 117 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 FHL2Q14192 279 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 IGKV2-30P06310 120 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 FHL3Q13643 280 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 Q6ZSN1 163 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 NRACQ8N912 160 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 C16orf90A8MZG2 172 aa8.5□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.49□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.48□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms