RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFE-214ENST00000625905 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFE-214ENST00000625905 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.09□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 PKD1P98161 4303 aa6.08□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 TMEM18Q96B42 140 aa6.08□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 USP17L23D6RBM5 183 aa6.07□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 CDK2AP2O75956 126 aa6.07□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 SNAPINO95295 136 aa6.07□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 RAB5AP20339 215 aa6.07□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 GCSHP23434 173 aa6.07□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.07□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.07□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.07□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.06□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 COX19Q49B96 90 aa6.06□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.06□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.05□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 MT-ND6P03923 174 aa6.05□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 KRTAP10-1P60331 282 aa6.05□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 Q6ZUT4 128 aa6.05□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.05□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.05□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.05□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.05□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.05□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.05□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.04□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 PRSS47A8MTI9 375 aa6.04□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 XCL1P47992 114 aa6.04□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 SS18Q15532 418 aa6.04□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.04□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 Q8N8P6 123 aa6.04□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.03□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 hDV102S1A0JD36 115 aa6.03□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 CCL25O15444 150 aa6.03□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
NELFE-214ENST00000625905 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.02□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 K7EMI3 77 aa6.02□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 PRSS1P07477 247 aa6.02□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 FOXI1Q12951 378 aa6.02□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 LINC01620Q4KN68 170 aa6.02□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.02□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 CFAP161Q6P656 301 aa6.02□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.02□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.02□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 IFITM10A6NMD0 228 aa6.01□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.01□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.01□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.01□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.01□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 C15orf56Q8N910 161 aa6.01□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 HIGD2BQ4VC39 106 aa6□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 Q6ZN92 141 aa6□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 HERC2O95714 4834 aa6□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 COX7A2LO14548 114 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 G0S2P27469 103 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 HAMPP81172 84 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 FA2HQ7L5A8 372 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 TMEM141Q96I45 108 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 MALP21145 153 aa5.98□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 XGP55808 180 aa5.98□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.98□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 Q6ZSA8 131 aa5.98□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 FAM104AQ969W3 186 aa5.98□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.98□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 RYR1P21817 5038 aa5.98□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.98□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 NPSP0C0P6 89 aa5.97□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.97□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 YPEL4Q96NS1 127 aa5.97□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.97□□□□□ -1.45
NELFE-214ENST00000625905 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.96□□□□□ -1.46
NELFE-214ENST00000625905 LINC01546A6NGU7 62 aa5.96□□□□□ -1.46
NELFE-214ENST00000625905 IGIPA6NJ69 53 aa5.96□□□□□ -1.46
NELFE-214ENST00000625905 APOMO95445 188 aa5.96□□□□□ -1.46
NELFE-214ENST00000625905 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.96□□□□□ -1.46
NELFE-214ENST00000625905 C5orf38Q86SI9 138 aa5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.8 ms