RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620410.1

PTPRT-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 940 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-212ENST00000620410 OSTCQ9NRP0 149 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 V9GYV3 84 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 ZNF727A8MUV8 499 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 SMKR1H3BMG3 65 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 ST20Q9HBF5 79 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 PHOX2AO14813 284 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 CCL25O15444 150 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 XCL1P47992 114 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 NUP35Q8NFH5 326 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-212ENST00000620410 A0A096LNI7 61 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 MAJINQ3KP22 176 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 NRACQ8N912 160 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 ISOC2Q96AB3 205 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 ODF1Q14990 250 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 MRAP2Q96G30 205 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 STPG4Q8N801 248 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 FAM104AQ969W3 186 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 BORCS7Q96B45 105 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 TMEM101Q96IK0 257 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 BTF3L4Q96K17 158 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 LINC01600Q96MT4 127 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 VCYO14598 125 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 RIGQ13278 110 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 SS18Q15532 418 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-212ENST00000620410 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 SYCNQ0VAF6 134 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 ADIRFQ15847 76 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 C7orf33Q8WU49 177 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 CARD19Q96LW7 228 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 A0A1W2PNN7 141 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 FCER1GP30273 86 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 CAMPP49913 170 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 Q6ZUT4 128 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 NAT8Q9UHE5 227 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 LPAP08519 4548 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 A0A0J9YXV3 536 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 C5orf38Q86SI9 138 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 A0A1B0GXF2 115 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 LINC00862A6NCI5 91 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 COX7A2LO14548 114 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 TNFRSF6BO95407 300 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 PPP1R17O96001 155 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 PTTG1IPP53801 180 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 KIR2DL4Q99706 377 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 C20orf78Q9BR46 151 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 PPP1R2P9O14990 202 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 NPYP01303 97 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 CKS2P33552 79 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 KRTAP10-8P60410 259 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 GAGE2BQ13066 116 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 PEA15Q15121 130 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 D6R8Y8 96 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-212ENST00000620410 MUC2Q02817 5179 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 A0A1B0GW15 77 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 TCAPO15273 167 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 MALP21145 153 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 C2orf48Q96LS8 159 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.02□□□□□ -1.29
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