RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	FLNC	Q14315	2725 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	FREM3	P0C091	2139 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	ESPL1	Q14674	2120 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	ANK2	Q01484	3957 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	HIVEP1	P15822	2718 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	RP1	P56715	2156 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227		H3BRM9	83 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC179	H3BU77	68 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227		J3QLW9	94 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	CCL22	O00626	93 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	SIX6	O95475	246 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	PPY	P01298	95 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	IFNA17	P01571	189 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	IGLV1-51	P01701	117 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	TSPAN19	P0C672	248 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	PYY	P10082	97 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	CXCL8	P10145	99 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	SNCA	P37840	140 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	TPPP2	P59282	170 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	ROMO1	P60602	79 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	S100A10	P60903	97 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	PPP3R1	P63098	170 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	QRFP	P83859	136 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	CATR1	Q13166	79 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	TDRG1	Q3Y452	100 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	MORN2	Q502X0	79 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	SPRN	Q5BIV9	151 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	PYY3	Q5JQD4	70 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227		Q6ZUT4	128 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	OR5AS1	Q8N127	324 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	SVBP	Q8N300	66 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	TSKU	Q8WUA8	353 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	PSMF1	Q92530	271 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	SPTSSA	Q969W0	71 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	PRO1933	Q9H354	126 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	RNF122	Q9H9V4	155 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	POLE	Q07864	2286 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	VPS13C	Q709C8	3753 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	RELN	P78509	3460 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF292	O60281	2723 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		0.4	□□□□□ -2.34
SNAP23-215	ENST00000568227	TET1	Q8NFU7	2136 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A087WXM4	84 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A1W2PRS3	328 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM218	A2RU14	115 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	OOSP1	A8MZH6	123 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227		F2Z2F3	143 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	CORT	O00230	105 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
SNAP23-215	ENST00000568227	CCL25	O15444	150 aa		0.4	□□□□□ -2.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms