RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563387.5

C15orf40-210, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf40, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-210ENST00000563387 VPS13CQ709C8 3753 aa3.27□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 MYO7BQ6PIF6 2116 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 A0A087WZ39 114 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 A0A0A0MQY5 61 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 PROP1O75360 226 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 PDE6HQ13956 83 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 C15orf32Q32M92 178 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 LINC01554Q52M75 96 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 ENHOQ6UWT2 76 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 BPESC1Q9GZL8 116 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 KLK15Q9H2R5 256 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM14BQ9NUH8 114 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00846Q9NV44 126 aa3.26□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 IGIPA6NJ69 53 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 H0Y9J4 135 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 IGHV1-69P01742 117 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 CCL4P13236 92 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 SYCNQ0VAF6 134 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 NREPQ16612 68 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 GPHB5Q86YW7 130 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 LIMD2Q9BT23 127 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 DSCAMO60469 2012 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 TLN2Q9Y4G6 2542 aa3.25□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 hDV103S1A0JD37 113 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 A6NN06 94 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 PSPHP1O15172 72 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 ZNHIT1O43257 154 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 IGLV2-11P01706 119 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 FOLR3P41439 243 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00313P59037 77 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 LINC01356Q8N9X3 169 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 AMELXQ99217 191 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 ANK2Q01484 3957 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 NACAE9PAV3 2078 aa3.24□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 ESPL1Q14674 2120 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 HCG22E2RYF7 251 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 H0YGX0 51 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 PRM2P04554 102 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 MED14OSP0DP75 135 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 KIAA0087Q14695 138 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 IGFL3Q6UXB1 125 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 DEFB119Q8N690 84 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 KNL1Q8NG31 2342 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.23□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 MED12Q93074 2177 aa3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 C12orf77C9JDV5 145 aa3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 H0YGG7 62 aa3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 FSTL3O95633 263 aa3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 CRPP02741 224 aa3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 FAM27BQ5VT28 67 aa3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 PATE2Q6UY27 113 aa3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 CASC2Q6XLA1 102 aa3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 Q6ZRP5 223 aa3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 C22orf34Q6ZV56 151 aa3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 COX14Q96I36 57 aa3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 C8orf49Q96NF6 230 aa3.22□□□□□ -1.89
C15orf40-210ENST00000563387 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.21□□□□□ -1.9
C15orf40-210ENST00000563387 A6NED7 52 aa3.21□□□□□ -1.9
C15orf40-210ENST00000563387 IGHV3-9P01782 118 aa3.21□□□□□ -1.9
C15orf40-210ENST00000563387 GNLYP22749 145 aa3.21□□□□□ -1.9
C15orf40-210ENST00000563387 LYZP61626 148 aa3.21□□□□□ -1.9
C15orf40-210ENST00000563387 C6orf99Q4VX62 202 aa3.21□□□□□ -1.9
C15orf40-210ENST00000563387 SCXQ7RTU7 201 aa3.21□□□□□ -1.9
C15orf40-210ENST00000563387 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.21□□□□□ -1.9
C15orf40-210ENST00000563387 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.4 ms