RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560350.5

USP3-AS1-206, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 407 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-206ENST00000560350 RNF185Q96GF1 192 aa4.98□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 BTF3L4Q96K17 158 aa4.98□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 C20orf78Q9BR46 151 aa4.98□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 DNAH2Q9P225 4427 aa4.98□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 PHOX2AO14813 284 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 CFAP161Q6P656 301 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 AMN1Q8IY45 258 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 TMEM18Q96B42 140 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 TMEM101Q96IK0 257 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 KIR2DL4Q99706 377 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-AS1-206ENST00000560350 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 CCL25O15444 150 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 FGF6P10767 208 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 ESDP10768 282 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 CKS2P33552 79 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 CAMPP49913 170 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 KRTAP10-1P60331 282 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 HBBP68871 147 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 IMMP2LQ96T52 175 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.95□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 NPSP0C0P6 89 aa4.95□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 FCER1GP30273 86 aa4.95□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.95□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.95□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 A0A1B0GXF2 115 aa4.94□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 TMEM218A2RU14 115 aa4.94□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.94□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 XGP55808 180 aa4.94□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 NRACQ8N912 160 aa4.94□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.94□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.94□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 FRAS1Q86XX4 4008 aa4.94□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 EPM2AB3EWF7 344 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 USP17L23D6RBM5 183 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 LECT2O14960 151 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 TNFRSF6BO95407 300 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 TSHBP01222 138 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 HLA-DQA1P01909 254 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 WFDC2Q14508 124 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 SS18Q15532 418 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 ORMDL3Q8N138 153 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 SEC11CQ9BY50 192 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 PRSS47A8MTI9 375 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 GAS8-AS1O95177 125 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 RAB5AP20339 215 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 G0S2P27469 103 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 IFITM2Q01629 132 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 COX19Q49B96 90 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 Q6ZSA8 131 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 D6R8Y8 96 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 SMKR1H3BMG3 65 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 K7EMI3 77 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 PRSS1P07477 247 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 S100PP25815 95 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-206ENST00000560350 PRELID3AQ96N28 172 aa4.9□□□□□ -1.63
USP3-AS1-206ENST00000560350 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.9□□□□□ -1.63
USP3-AS1-206ENST00000560350 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.9□□□□□ -1.63
USP3-AS1-206ENST00000560350 PKD1P98161 4303 aa4.89□□□□□ -1.63
USP3-AS1-206ENST00000560350 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms