RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
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RABGGTA-211ENST00000559850 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTA-211ENST00000559850 KIR2DL4Q99706 377 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTA-211ENST00000559850 C20orf78Q9BR46 151 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTA-211ENST00000559850 TCAPO15273 167 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTA-211ENST00000559850 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-211ENST00000559850 C15orf56Q8N910 161 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-211ENST00000559850 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTA-211ENST00000559850 SLPIP03973 132 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-211ENST00000559850 FOXI1Q12951 378 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-211ENST00000559850 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.59□□□□□ -0.87
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RABGGTA-211ENST00000559850 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-211ENST00000559850 SCXQ7RTU7 201 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.59□□□□□ -0.87
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RABGGTA-211ENST00000559850 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.59□□□□□ -0.87
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RABGGTA-211ENST00000559850 Q6ZUT4 128 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 ORMDL3Q8N138 153 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 PPBPP02775 128 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 PANO1I0J062 215 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM229AH3BQW9 127 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 PHOX2AO14813 284 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 SS18Q15532 418 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 SEC11CQ9BY50 192 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM104AQ969W3 186 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 CFAP161Q6P656 301 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 TMEM18Q96B42 140 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 IMMP2LQ96T52 175 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-211ENST00000559850 CHTF8P0CG12 524 aa9.52□□□□□ -0.89
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RABGGTA-211ENST00000559850 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.52□□□□□ -0.89
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RABGGTA-211ENST00000559850 RAB5AP20339 215 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 C5orf38Q86SI9 138 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 Q8N8P6 123 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 PRSS47A8MTI9 375 aa9.48□□□□□ -0.89
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RABGGTA-211ENST00000559850 COX6A2Q02221 97 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 COX7A2LO14548 114 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 MALP21145 153 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTA-211ENST00000559850 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 IFITM10A6NMD0 228 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 RHEBQ15382 184 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 DPH3Q96FX2 82 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 APOC3P02656 99 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 CARD19Q96LW7 228 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTA-211ENST00000559850 A0A087WYN8 130 aa9.43□□□□□ -0.9
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