RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 CAMPP49913 170 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 MED9Q9NWA0 146 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 H7C423 109 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 SS18Q15532 418 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 BCL2L11O43521 198 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 I3L3M4 83 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 TSHBP01222 138 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 MALP21145 153 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 ZNF345Q14585 488 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 NUP35Q8NFH5 326 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 CNFNQ9BYD5 112 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-227ENST00000551441 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 K7EN84 100 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 ESDP10768 282 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 PRR4Q16378 134 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 ISOC2Q96AB3 205 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 SMIM12Q96EX1 92 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 C5orf38Q86SI9 138 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 MRAP2Q96G30 205 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 BIN3Q9NQY0 253 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 COX7A2LO14548 114 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 APOMO95445 188 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 OCC1Q8TAD7 63 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 ST20Q9HBF5 79 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 A0A087WZ39 114 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 FAM168BA1KXE4 195 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 PDE6DO43924 150 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 IGLV7-43P04211 117 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 TEX261Q6UWH6 196 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 DIRC1Q969H9 104 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 HMSDA8MTL9 139 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-227ENST00000551441 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 H0Y9J4 135 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 SMKR1H3BMG3 65 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 TEX46H3BTG2 121 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 SPAG11BQ08648 103 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 C2orf48Q96LS8 159 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 Q6ZUT4 128 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 FCER1GP30273 86 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 RGS21Q2M5E4 152 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 C10orf25Q5T742 122 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 AMN1Q8IY45 258 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 RAB4AP20338 218 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 UBE2D1P51668 147 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 GAGE2EQ4V326 116 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 FAT4Q6V0I7 4981 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 A8MWL6 223 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 CEBPGP53567 150 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-227ENST00000551441 TSPAN13O95857 204 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.64□□□□□ -0.87
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CS-227ENST00000551441 BORCS7Q96B45 105 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 VCYO14598 125 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 UBE2BP63146 152 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 RNF151Q2KHN1 245 aa9.63□□□□□ -0.87
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CS-227ENST00000551441 A0A0U1RQV1 116 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 BATF3Q9NR55 127 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GUT8 65 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 HIGD1CA8MV81 97 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 IMMP2LQ96T52 175 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 M0QXV9 152 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-227ENST00000551441 NDUFA1O15239 70 aa9.6□□□□□ -0.87
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