RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-225	ENST00000551253	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CS-225	ENST00000551253	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CS-225	ENST00000551253	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253		A0A1B0GUV1	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253		H7C423	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	UBE2L6	O14933	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	APCS	P02743	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	PMCH	P20382	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	AMT	P48728	403 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	RBX1	P62877	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	S100A12	P80511	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	NRAC	Q8N912	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	RMI2	Q96E14	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253		Q9HAA7	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253		A0A0J9YXV3	536 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	PHOX2A	O14813	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	CRP	P02741	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	PPBP	P02775	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253		Q8N976	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253		D6R8Y8	96 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	VCY	O14598	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	TSHB	P01222	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	ESD	P10768	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	CKS2	P33552	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	RHEB	Q15382	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	MIA	Q16674	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	TCAP	O15273	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	NPY	P01303	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	S100P	P25815	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	REG3A	Q06141	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	WFDC2	Q14508	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	SNAPIN	O95295	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	APOC3	P02656	99 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	FGF6	P10767	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	FCER1G	P30273	86 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	SVBP	Q8N300	66 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	COX19	Q49B96	90 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CS-225	ENST00000551253	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	LECT2	O14960	151 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	MT-ND6	P03923	174 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253		Q8N8P6	123 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CS-225	ENST00000551253	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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