RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550361.1

IRAK4-208, Transcript of interleukin 1 receptor associated kinase 4, human

TSL 4

Gene IRAK4, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRAK4-208	ENST00000550361	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	FRZB	Q92765	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361		B5MCH6	92 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	ESD	P10768	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	CAMP	P49913	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	REG3A	Q06141	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	RIG	Q13278	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	MIA	Q16674	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361		Q6ZSA8	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	RMI2	Q96E14	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361		I3L3M4	83 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	CRP	P02741	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	SLPI	P03973	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	FGF6	P10767	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	NPY	P01303	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	APCS	P02743	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	PMCH	P20382	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	PKIA	P61925	76 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRAK4-208	ENST00000550361	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361		D6R8Y8	96 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	PANO1	I0J062	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	UBE2L6	O14933	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	RAB14	P61106	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	HBB	P68871	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361		H7C423	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	FOXI1	Q12951	378 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361		Q5VSD8	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	HERC1	Q15751	4861 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361		A0A1B0GW15	77 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	VCY	O14598	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	CKS2	P33552	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	TCAP	O15273	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361		F8W036	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	CCL25	O15444	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	XCL1	P47992	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IRAK4-208	ENST00000550361	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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