RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 LST1O00453 97 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 CASC2Q6XLA1 102 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRB-208ENST00000550358 TRIAP1O43715 76 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV4-1P06312 121 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-208ENST00000550358 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.18□□□□□ -1.42
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PTPRB-208ENST00000550358 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.1□□□□□ -1.43
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PTPRB-208ENST00000550358 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRB-208ENST00000550358 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.07□□□□□ -1.44
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