RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541175.1

PRR4-208, Transcript of proline rich 4, human

TSL 2

Gene PRR4, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-208	ENST00000541175	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	MBD2	Q9UBB5	411 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	ALG5	Q9Y673	324 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175		L7N2F9	121 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	HPGDS	O60760	199 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	NTF3	P20783	257 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	SPRR2E	P22531	72 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	SPRR2B	P35325	72 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	SPRR2A	P35326	72 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	BCAP31	P51572	246 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	VAMP2	P63027	116 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	AP1S3	Q96PC3	154 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	VCX	Q9H320	206 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	FAM25A	B3EWG3	89 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	FAM25C	B3EWG5	89 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	FAM25G	B3EWG6	89 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175		M0QY20	66 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	CST7	O76096	145 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	MGP	P08493	103 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	HBG1	P69891	147 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	HBG2	P69892	147 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	CCDC32	Q9BV29	185 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	C7orf66	A4D0T2	115 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	CTDSP2	O14595	271 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	APCS	P02743	223 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	OR5AL1	P0C617	328 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	S100A11	P31949	105 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	RASL11A	Q6T310	242 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	MCUB	Q9NWR8	336 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	PRY	O14603	147 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	NCR2	O95944	276 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	NCS1	P62166	190 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	C5orf38	Q86SI9	138 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	STX12	Q86Y82	276 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	NIT2	Q9NQR4	276 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PRR4-208	ENST00000541175	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175		A6NN06	94 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	SH2D1A	O60880	128 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	SFT2D2	O95562	160 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	IGLV6-57	P01721	117 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	UBE2G2	P60604	165 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	PRLH	P81277	87 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	ATP6V1F	Q16864	119 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	SULT1A1	P50225	295 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	SST	P61278	116 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	THAP6	Q8TBB0	222 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	LINC00167	Q96N53	147 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	GAGE10	A6NGK3	116 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	MT3	P25713	68 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	DEFA3	P59666	94 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	C6orf99	Q4VX62	202 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	LINC01551	Q86U37	167 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	MCFD2	Q8NI22	146 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	MRAP2	Q96G30	205 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	SPRR4	Q96PI1	79 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	EPDR1	Q9UM22	224 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PRR4-208	ENST00000541175	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91

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