RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540115.1

ACSL3-210, Transcript of acyl-CoA synthetase long chain family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene ACSL3, Length 624 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3-210ENST00000540115 VCYO14598 125 aa6.51□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 TCAPO15273 167 aa6.51□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 PRSS1P07477 247 aa6.51□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 FGF6P10767 208 aa6.51□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 LINC01620Q4KN68 170 aa6.51□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 AMN1Q8IY45 258 aa6.51□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.51□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 TMEM18Q96B42 140 aa6.51□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 KIR2DL4Q99706 377 aa6.51□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.5□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 LINC00862A6NCI5 91 aa6.5□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.5□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.5□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.49□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.49□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.49□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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ACSL3-210ENST00000540115 SS18Q15532 418 aa6.49□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 SCXQ7RTU7 201 aa6.49□□□□□ -1.37
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ACSL3-210ENST00000540115 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.49□□□□□ -1.37
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ACSL3-210ENST00000540115 C9JQL5 133 aa6.48□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 TSHBP01222 138 aa6.48□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 CKS2P33552 79 aa6.48□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 CAMPP49913 170 aa6.48□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 HBBP68871 147 aa6.48□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.48□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 DPH3Q96FX2 82 aa6.48□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 FAT1Q14517 4588 aa6.48□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 CCL25O15444 150 aa6.47□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 ESDP10768 282 aa6.47□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.47□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 C20orf78Q9BR46 151 aa6.47□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.46□□□□□ -1.37
ACSL3-210ENST00000540115 SMKR1H3BMG3 65 aa6.46□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 PPBPP02775 128 aa6.46□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.46□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.46□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.45□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 PHOX2AO14813 284 aa6.45□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 MT-ND4LP03901 98 aa6.45□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 XCL1P47992 114 aa6.45□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 NRACQ8N912 160 aa6.45□□□□□ -1.38
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ACSL3-210ENST00000540115 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.44□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.44□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.44□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 GAS8-AS1O95177 125 aa6.44□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 MALP21145 153 aa6.44□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.44□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.44□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.44□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.43□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 TNFRSF6BO95407 300 aa6.43□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 RAB5AP20339 215 aa6.43□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 FOXI1Q12951 378 aa6.43□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.43□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 ORMDL3Q8N138 153 aa6.43□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.43□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 A0A1B0GXF2 115 aa6.42□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 D6R8Y8 96 aa6.42□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.42□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 C15orf56Q8N910 161 aa6.42□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.42□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.42□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.41□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 COX7A2LO14548 114 aa6.41□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 APOMO95445 188 aa6.41□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 CLLU1Q5K131 121 aa6.41□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.41□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.41□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.41□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.4□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 UQCC3Q6UW78 93 aa6.4□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 C7orf33Q8WU49 177 aa6.4□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 PRELID3AQ96N28 172 aa6.4□□□□□ -1.38
ACSL3-210ENST00000540115 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
ACSL3-210ENST00000540115 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
ACSL3-210ENST00000540115 NPYP01303 97 aa6.39□□□□□ -1.39
ACSL3-210ENST00000540115 SLPIP03973 132 aa6.39□□□□□ -1.39
ACSL3-210ENST00000540115 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
ACSL3-210ENST00000540115 COX6A2Q02221 97 aa6.39□□□□□ -1.39
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