RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 K7EP13 123 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 PRR9Q5T870 116 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 CADP27708 2225 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM223A0PJW6 202 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 NUPR1O60356 82 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 C5orf47Q569G3 176 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 HIVEP2P31629 2446 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 IGLV2-8P01709 118 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 M0R378 163 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 CRIP1P50238 77 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-204ENST00000538708 KLLNB2CW77 178 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 PDE6GP18545 87 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 IGLV2-11P01706 119 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 TSHBP01222 138 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 CACNA1HO95180 2353 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 MED12LQ86YW9 2145 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 M0QXV9 152 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 BPY2O14599 106 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 HIGD1BQ9P298 99 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 FXYD2P54710 66 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1B0GXF2 115 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 SLPIP03973 132 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 MLST8Q9BVC4 326 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 FHL3Q13643 280 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 RNF185Q96GF1 192 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM258P61165 79 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf137Q5JT78 98 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 ABCA1O95477 2261 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 TDRG1Q3Y452 100 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 TCL1BO95988 128 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.84□□□□□ -1.31
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PTPRB-204ENST00000538708 C6orf223Q8N319 242 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 MDFIQ99750 246 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 A8MZ25 164 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 C6orf99Q4VX62 202 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 C10orf25Q5T742 122 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 COX17Q14061 63 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-204ENST00000538708 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 FHL2Q14192 279 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 REG3GQ6UW15 175 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 SCXQ7RTU7 201 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
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PTPRB-204ENST00000538708 C3orf84H3BNL1 204 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 H3BT86 120 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 Q8IZM0 81 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF580Q9UK33 172 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 COL4A2P08572 1712 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.81□□□□□ -1.32
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PTPRB-204ENST00000538708 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 NBASA2RRP1 2371 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.81□□□□□ -1.32
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PTPRB-204ENST00000538708 CCKP06307 115 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 CREBBPQ92793 2442 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 NRACQ8N912 160 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 ATOX1O00244 68 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 TEN1Q86WV5 123 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 Q8N2B8 174 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-204ENST00000538708 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.78□□□□□ -1.32
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