RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531494.1

TMEM25-222, Transcript of transmembrane protein 25, human

TSL 4

Gene TMEM25, Length 1,280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM25-222	ENST00000531494	HIGD1C	A8MV81	97 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	FCER1G	P30273	86 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	C7orf33	Q8WU49	177 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	GTSF1	Q8WW33	167 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	TMEM18	Q96B42	140 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	PPP1R2P9	O14990	202 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	CCL25	O15444	150 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	S100A8	P05109	93 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	FGF6	P10767	208 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	SS18	Q15532	418 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	LINC01551	Q86U37	167 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	KIR2DL4	Q99706	377 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494		A0A1B0GW15	77 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	ISOC2	Q96AB3	205 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	VCY	O14598	125 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	RAB5A	P20339	215 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	FAT1	Q14517	4588 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	MAL	P21145	153 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	ADIRF	Q15847	76 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	XCL1	P47992	114 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	APOM	O95445	188 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	RAB4A	P20338	218 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	RAB5B	P61020	215 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	MYCBP2	O75592	4640 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	ESD	P10768	282 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494		Q6ZRU5	148 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	AMN1	Q8IY45	258 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	C15orf56	Q8N910	161 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	IMMP2L	Q96T52	175 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	C20orf78	Q9BR46	151 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	TSHB	P01222	138 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494	NUP35	Q8NFH5	326 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM25-222	ENST00000531494		A0A087WYN8	130 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	COX7A2L	O14548	114 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	PHOX2A	O14813	284 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	PPBP	P02775	128 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	CKS2	P33552	79 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	COX6A2	Q02221	97 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	MAJIN	Q3KP22	176 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	CARD19	Q96LW7	228 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494		V9GYV3	84 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	FOXI1	Q12951	378 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	HERC1	Q15751	4861 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	C5orf52	A6NGY3	159 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	CAMP	P49913	170 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	HBB	P68871	147 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	S100P	P25815	95 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	SYCN	Q0VAF6	134 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	STPG4	Q8N801	248 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494		F8WDY8	70 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TMEM25-222	ENST00000531494	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TMEM25-222	ENST00000531494	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TMEM25-222	ENST00000531494	SLPI	P03973	132 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TMEM25-222	ENST00000531494	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMEM25-222	ENST00000531494	TRGC2	P03986	189 aa		10.01	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms