RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531474.2

NXF1-209, Transcript of nuclear RNA export factor 1, human

TSL 3

Gene NXF1, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NXF1-209	ENST00000531474	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	LYRM9	A8MSI8	78 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474		H7C423	109 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474		Q6ZSN1	163 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	ZNF479	Q96JC4	524 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	AMELX	Q99217	191 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	NACA	E9PAV3	2078 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	GAGE12B	A1L429	117 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	GAGE7	O76087	117 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	GAGE12F	P0CL80	117 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	GAGE12G	P0CL81	117 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	GAGE12I	P0CL82	117 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	DEFB130B	P0DP73	79 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	DEFB130A	P0DP74	79 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	DAD1	P61803	113 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	C12orf74	Q32Q52	190 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	PCP2	Q8IVA1	136 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	UBE2D3	P61077	147 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	UBE2D2	P62837	147 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474		Q6ZTC4	211 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	MUC7	Q8TAX7	377 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		6.66	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	HTN3	P15516	51 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	GAGE1	Q13065	139 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		6.65	□□□□□ -1.34
NXF1-209	ENST00000531474		H3BRM9	83 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	LEPROT	O15243	131 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	COX11	Q9Y6N1	276 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	UBE2L6	O14933	153 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	TIRAP	P58753	221 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	FHL2	Q14192	279 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	TMEM101	Q96IK0	257 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	TMEM243	Q9BU79	118 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	TM2D2	Q9BX73	214 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	TMEM223	A0PJW6	202 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	GAGE12J	A6NER3	117 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	NUPR2	A6NF83	97 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	ZNF815P	A8K554	130 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	C3orf84	H3BNL1	204 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	SMIM13	P0DJ93	91 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	PTTG1IP	P53801	180 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	TCTA	P57738	103 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	GAGE4	Q13068	117 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	GAGE5	Q13069	117 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	GAGE13	Q4V321	117 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	CEND1	Q8N111	149 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	HIST1H4G	Q99525	98 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474		Q9UF83	564 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	PRO0255	Q9UI72	69 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474		A0A0J9YXV3	536 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474		F5H768	121 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474		J3QQQ9	107 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	ATP5G1	P05496	136 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	HERVK_113	P63121	156 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	TAX1BP3	O14907	124 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	GCSH	P23434	173 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	6.6	□□□□□ -1.35
NXF1-209	ENST00000531474	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		6.6	□□□□□ -1.35

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