RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM242Q9NWH2 141 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRU-210ENST00000527027 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRU-210ENST00000527027 V9GYV3 84 aa10.1□□□□□ -0.79
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PTPRU-210ENST00000527027 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
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PTPRU-210ENST00000527027 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRU-210ENST00000527027 MRAP2Q96G30 205 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRU-210ENST00000527027 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRU-210ENST00000527027 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.9□□□□□ -0.82
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PTPRU-210ENST00000527027 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRU-210ENST00000527027 LPAP08519 4548 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 A0A1W2PNN7 141 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 RAB4AP20338 218 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRU-210ENST00000527027 TSHBP01222 138 aa9.87□□□□□ -0.83
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