RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 PYDC1Q8WXC3 89 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 LINC00472Q9H8W2 130 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 V9GYH0 126 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 TGP01266 2768 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 COPZ1P61923 177 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 PIGYQ3MUY2 71 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 LZICQ8WZA0 190 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 AMELXQ99217 191 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 DPH3Q96FX2 82 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 AQP10Q96PS8 301 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 COPZ2Q9P299 210 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 CEP152O94986 1710 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAT1Q14517 4588 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMIM21Q3B7S5 101 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 COX6B1P14854 86 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 DR1Q01658 176 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMCO1Q147U7 214 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 Q8N8P6 123 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSLPQ969D9 159 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDCD10Q9BUL8 212 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNFP01375 233 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 COX17Q14061 63 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 Q6AWC8 147 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 PSME4Q14997 1843 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-344P-201ENST00000516635 BTAF1O14981 1849 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 F8VRH5 84 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 BAGE2Q86Y30 109 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 DNAJC13O75165 2243 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGLC7A0M8Q6 106 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 UQCR11O14957 56 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAFIPQ8WZ33 124 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 TCEAL4Q96EI5 215 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 DEFB123Q8N688 67 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC167Q9P0B6 97 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 GRIN2AQ12879 1464 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 M0R2T5 61 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 HMGN4O00479 90 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 CREBBPQ92793 2442 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 PHLPP1O60346 1717 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 CFTRP13569 1480 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 APOC3P02656 99 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARPC4P59998 168 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 DEFB105AQ8NG35 78 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 MGST2Q99735 147 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 SERP1Q9Y6X1 66 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 NSD3Q9BZ95 1437 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 FOCADQ5VW36 1801 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 TPPP2P59282 170 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 C12orf73Q69YU5 71 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYH7P12883 1935 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 HERC2O95714 4834 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-344P-201ENST00000516635 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPINK4O60575 86 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-344P-201ENST00000516635 SFT2D2O95562 160 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-344P-201ENST00000516635 PFDN5Q99471 154 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-344P-201ENST00000516635 RERGLQ9H628 205 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-344P-201ENST00000516635 BICRAQ9NZM4 1560 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-344P-201ENST00000516635 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-344P-201ENST00000516635 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-344P-201ENST00000516635 MEIG1Q5JSS6 88 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-344P-201ENST00000516635 LINC00474Q9P2X8 69 aa-0.86□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms