RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 LINC00862A6NCI5 91 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 M0R143 59 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 CORTO00230 105 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 OR7C2O60412 319 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 PITX3O75364 302 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 IL4P05112 153 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 SMIM17P0DL12 118 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 FAM236CP0DP71 79 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 OR10J1P30954 320 aa2.66□□□□□ -1.98
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PDE4D-217ENST00000509355 RHEBQ15382 184 aa2.66□□□□□ -1.98
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PDE4D-217ENST00000509355 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.66□□□□□ -1.98
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PDE4D-217ENST00000509355 TEX261Q6UWH6 196 aa2.66□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.66□□□□□ -1.98
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PDE4D-217ENST00000509355 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
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PDE4D-217ENST00000509355 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
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PDE4D-217ENST00000509355 IGHV3-33P01772 117 aa2.65□□□□□ -1.99
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PDE4D-217ENST00000509355 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa2.65□□□□□ -1.99
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PDE4D-217ENST00000509355 OR5H6Q8NGV6 325 aa2.65□□□□□ -1.99
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PDE4D-217ENST00000509355 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 NUP35Q8NFH5 326 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 OR13C8Q8NGS7 320 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 TXNDC17Q9BRA2 123 aa2.64□□□□□ -1.99
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PDE4D-217ENST00000509355 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.64□□□□□ -1.99
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PDE4D-217ENST00000509355 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.64□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa2.63□□□□□ -1.99
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PDE4D-217ENST00000509355 FABP5P3A8MUU1 101 aa2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 J3QR89 54 aa2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 IGKV1-17P01599 117 aa2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 TGFBR1P36897 503 aa2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 LPAR6P43657 344 aa2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 GNG4P50150 75 aa2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 FXYD4P59646 89 aa2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 QRFPP83859 136 aa2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 SPINK9Q5DT21 86 aa2.63□□□□□ -1.99
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PDE4D-217ENST00000509355 TCTE3Q8IZS6 198 aa2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa2.63□□□□□ -1.99
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PDE4D-217ENST00000509355 SMIM3Q9BZL3 60 aa2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 CST9LQ9H4G1 147 aa2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa2.62□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 IFITM5A6NNB3 132 aa2.62□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 A8MTW9 85 aa2.62□□□□□ -1.99
PDE4D-217ENST00000509355 COX7A2LO14548 114 aa2.62□□□□□ -1.99
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