RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507538.1

RASGEF1B-205, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 691 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-205ENST00000507538 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.87□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa11.87□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 MT-ND6P03923 174 aa11.87□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.87□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 KIAA1644Q3SXP7 199 aa11.87□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 TMEM18Q96B42 140 aa11.87□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 RAB5AP20339 215 aa11.86□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.86□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa11.85□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 Q8N8P6 123 aa11.85□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 TIMM21Q9BVV7 248 aa11.85□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.85□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZNF664Q8N3J9 261 aa11.84□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RASGEF1B-205ENST00000507538 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.83□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 USP17L23D6RBM5 183 aa11.82□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.82□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 Q6ZUT4 128 aa11.82□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.82□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 C14orf177Q52M58 125 aa11.81□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 YPEL4Q96NS1 127 aa11.81□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.8□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 GAGE12HA6NDE8 117 aa11.8□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 K7EMI3 77 aa11.79□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.79□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 CBLN2Q8IUK8 224 aa11.79□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 SMCO4Q9NRQ5 59 aa11.79□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa11.79□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 GCSHP23434 173 aa11.78□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 XCL1P47992 114 aa11.78□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 SS18Q15532 418 aa11.78□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11.77□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 DNAH5Q8TE73 4624 aa11.77□□□□□ -0.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 CCL25O15444 150 aa11.77□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP10-1P60331 282 aa11.77□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 FAM104AQ969W3 186 aa11.77□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 CYSLTR1Q9Y271 337 aa11.77□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 PRSS1P07477 247 aa11.76□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 FOXI1Q12951 378 aa11.76□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.76□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa11.76□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa11.76□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.75□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 CDK2AP2O75956 126 aa11.74□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.74□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa11.73□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 LINC01546A6NGU7 62 aa11.73□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 C1orf196B1AJZ1 125 aa11.73□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 C15orf56Q8N910 161 aa11.73□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 hDV102S1A0JD36 115 aa11.72□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 G0S2P27469 103 aa11.72□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 CFAP161Q6P656 301 aa11.72□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 FA2HQ7L5A8 372 aa11.72□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 IFITM10A6NMD0 228 aa11.71□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 TMEM141Q96I45 108 aa11.71□□□□□ -0.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 C18orf32Q8TCD1 76 aa11.7□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 TOMM6Q96B49 74 aa11.7□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 IGIPA6NJ69 53 aa11.69□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 NPSP0C0P6 89 aa11.69□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 LINC01620Q4KN68 170 aa11.69□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 CNBPP62633 177 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.68□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 Q6ZN92 141 aa11.68□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 TEX43Q6ZNM6 134 aa11.68□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 AP5S1Q9NUS5 200 aa11.68□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 KIAA1109Q2LD37 5005 aa11.68□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa11.67□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 COX7A2LO14548 114 aa11.67□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 TIMM17AQ99595 171 aa11.67□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 LINC00173Q6ZV60 143 aa11.66□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa11.66□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 AMELXQ99217 191 aa11.66□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 C2orf88Q9BSF0 95 aa11.66□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 LINC01549A6NIU2 74 aa11.65□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 SLPIP03973 132 aa11.65□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa11.65□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 SCGB3A1Q96QR1 104 aa11.65□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 VCX2Q9H322 139 aa11.65□□□□□ -0.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 HERC2O95714 4834 aa11.65□□□□□ -0.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 APOBP04114 4563 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 MALP21145 153 aa11.64□□□□□ -0.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 UBE2D1P51668 147 aa11.64□□□□□ -0.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 XGP55808 180 aa11.64□□□□□ -0.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.64□□□□□ -0.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 ERASQ7Z444 233 aa11.64□□□□□ -0.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 C5orf38Q86SI9 138 aa11.64□□□□□ -0.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 C9orf163Q8N9P6 203 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms